Protein–RNA interactions for Protein: P48052

CPA2, Carboxypeptidase A2, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA2P48052 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CPA2P48052 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CPA2P48052 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CPA2P48052 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CPA2P48052 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CPA2P48052 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CPA2P48052 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CPA2P48052 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CPA2P48052 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CPA2P48052 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CPA2P48052 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CPA2P48052 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CPA2P48052 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CPA2P48052 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CPA2P48052 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CPA2P48052 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CPA2P48052 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CPA2P48052 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CPA2P48052 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CPA2P48052 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CPA2P48052 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CPA2P48052 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CPA2P48052 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CPA2P48052 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CPA2P48052 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CPA2P48052 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CPA2P48052 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CPA2P48052 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CPA2P48052 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CPA2P48052 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CPA2P48052 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CPA2P48052 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CPA2P48052 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CPA2P48052 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CPA2P48052 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CPA2P48052 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CPA2P48052 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CPA2P48052 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CPA2P48052 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CPA2P48052 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CPA2P48052 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CPA2P48052 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CPA2P48052 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CPA2P48052 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CPA2P48052 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CPA2P48052 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CPA2P48052 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CPA2P48052 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CPA2P48052 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CPA2P48052 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CPA2P48052 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CPA2P48052 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CPA2P48052 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CPA2P48052 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CPA2P48052 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CPA2P48052 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CPA2P48052 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CPA2P48052 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CPA2P48052 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CPA2P48052 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CPA2P48052 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CPA2P48052 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CPA2P48052 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CPA2P48052 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CPA2P48052 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CPA2P48052 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CPA2P48052 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CPA2P48052 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CPA2P48052 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CPA2P48052 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CPA2P48052 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CPA2P48052 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CPA2P48052 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CPA2P48052 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CPA2P48052 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CPA2P48052 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CPA2P48052 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CPA2P48052 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CPA2P48052 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CPA2P48052 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CPA2P48052 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CPA2P48052 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CPA2P48052 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CPA2P48052 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CPA2P48052 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CPA2P48052 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CPA2P48052 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CPA2P48052 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CPA2P48052 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CPA2P48052 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CPA2P48052 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CPA2P48052 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CPA2P48052 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CPA2P48052 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CPA2P48052 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CPA2P48052 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CPA2P48052 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CPA2P48052 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CPA2P48052 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CPA2P48052 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms