Protein–RNA interactions for Protein: P47870

GABRB2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB2P47870 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GABRB2P47870 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GABRB2P47870 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GABRB2P47870 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GABRB2P47870 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GABRB2P47870 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GABRB2P47870 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GABRB2P47870 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GABRB2P47870 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GABRB2P47870 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GABRB2P47870 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GABRB2P47870 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GABRB2P47870 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
GABRB2P47870 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
GABRB2P47870 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GABRB2P47870 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
GABRB2P47870 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GABRB2P47870 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
GABRB2P47870 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GABRB2P47870 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GABRB2P47870 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GABRB2P47870 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GABRB2P47870 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GABRB2P47870 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GABRB2P47870 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GABRB2P47870 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GABRB2P47870 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
GABRB2P47870 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GABRB2P47870 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
GABRB2P47870 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GABRB2P47870 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GABRB2P47870 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GABRB2P47870 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GABRB2P47870 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
GABRB2P47870 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GABRB2P47870 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GABRB2P47870 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GABRB2P47870 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GABRB2P47870 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GABRB2P47870 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GABRB2P47870 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GABRB2P47870 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GABRB2P47870 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
GABRB2P47870 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GABRB2P47870 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GABRB2P47870 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
GABRB2P47870 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GABRB2P47870 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GABRB2P47870 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GABRB2P47870 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GABRB2P47870 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GABRB2P47870 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
GABRB2P47870 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GABRB2P47870 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GABRB2P47870 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GABRB2P47870 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GABRB2P47870 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GABRB2P47870 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GABRB2P47870 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GABRB2P47870 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GABRB2P47870 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GABRB2P47870 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GABRB2P47870 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GABRB2P47870 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GABRB2P47870 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GABRB2P47870 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GABRB2P47870 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GABRB2P47870 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GABRB2P47870 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GABRB2P47870 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
GABRB2P47870 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GABRB2P47870 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GABRB2P47870 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GABRB2P47870 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
GABRB2P47870 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GABRB2P47870 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GABRB2P47870 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GABRB2P47870 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GABRB2P47870 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GABRB2P47870 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GABRB2P47870 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GABRB2P47870 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GABRB2P47870 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
GABRB2P47870 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GABRB2P47870 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23■■□□□ 1.27
GABRB2P47870 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GABRB2P47870 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GABRB2P47870 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GABRB2P47870 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GABRB2P47870 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GABRB2P47870 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GABRB2P47870 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GABRB2P47870 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GABRB2P47870 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GABRB2P47870 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GABRB2P47870 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GABRB2P47870 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GABRB2P47870 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GABRB2P47870 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GABRB2P47870 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms