Protein–RNA interactions for Protein: P46926

GNPDA1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPDA1P46926 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GNPDA1P46926 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GNPDA1P46926 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GNPDA1P46926 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GNPDA1P46926 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GNPDA1P46926 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GNPDA1P46926 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GNPDA1P46926 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GNPDA1P46926 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GNPDA1P46926 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GNPDA1P46926 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GNPDA1P46926 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GNPDA1P46926 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GNPDA1P46926 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GNPDA1P46926 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GNPDA1P46926 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GNPDA1P46926 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GNPDA1P46926 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GNPDA1P46926 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GNPDA1P46926 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
GNPDA1P46926 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GNPDA1P46926 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GNPDA1P46926 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GNPDA1P46926 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GNPDA1P46926 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GNPDA1P46926 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GNPDA1P46926 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GNPDA1P46926 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GNPDA1P46926 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GNPDA1P46926 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GNPDA1P46926 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GNPDA1P46926 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GNPDA1P46926 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GNPDA1P46926 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GNPDA1P46926 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GNPDA1P46926 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GNPDA1P46926 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GNPDA1P46926 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GNPDA1P46926 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GNPDA1P46926 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GNPDA1P46926 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GNPDA1P46926 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GNPDA1P46926 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GNPDA1P46926 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GNPDA1P46926 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GNPDA1P46926 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GNPDA1P46926 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GNPDA1P46926 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
GNPDA1P46926 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GNPDA1P46926 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GNPDA1P46926 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GNPDA1P46926 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GNPDA1P46926 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GNPDA1P46926 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GNPDA1P46926 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GNPDA1P46926 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GNPDA1P46926 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GNPDA1P46926 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GNPDA1P46926 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GNPDA1P46926 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GNPDA1P46926 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GNPDA1P46926 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GNPDA1P46926 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GNPDA1P46926 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GNPDA1P46926 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GNPDA1P46926 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GNPDA1P46926 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GNPDA1P46926 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GNPDA1P46926 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GNPDA1P46926 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GNPDA1P46926 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GNPDA1P46926 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GNPDA1P46926 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GNPDA1P46926 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GNPDA1P46926 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GNPDA1P46926 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GNPDA1P46926 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GNPDA1P46926 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GNPDA1P46926 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GNPDA1P46926 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GNPDA1P46926 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GNPDA1P46926 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GNPDA1P46926 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GNPDA1P46926 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GNPDA1P46926 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GNPDA1P46926 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
GNPDA1P46926 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GNPDA1P46926 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GNPDA1P46926 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GNPDA1P46926 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GNPDA1P46926 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GNPDA1P46926 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GNPDA1P46926 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GNPDA1P46926 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GNPDA1P46926 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GNPDA1P46926 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GNPDA1P46926 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GNPDA1P46926 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GNPDA1P46926 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GNPDA1P46926 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms