Protein–RNA interactions for Protein: P45452

MMP13, Collagenase 3, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP13P45452 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MMP13P45452 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
MMP13P45452 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MMP13P45452 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MMP13P45452 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MMP13P45452 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MMP13P45452 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MMP13P45452 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MMP13P45452 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MMP13P45452 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MMP13P45452 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MMP13P45452 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MMP13P45452 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MMP13P45452 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MMP13P45452 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MMP13P45452 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MMP13P45452 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MMP13P45452 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MMP13P45452 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MMP13P45452 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MMP13P45452 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MMP13P45452 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MMP13P45452 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MMP13P45452 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MMP13P45452 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MMP13P45452 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MMP13P45452 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MMP13P45452 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MMP13P45452 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MMP13P45452 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MMP13P45452 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MMP13P45452 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MMP13P45452 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MMP13P45452 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MMP13P45452 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MMP13P45452 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MMP13P45452 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MMP13P45452 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MMP13P45452 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MMP13P45452 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
MMP13P45452 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
MMP13P45452 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
MMP13P45452 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MMP13P45452 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MMP13P45452 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MMP13P45452 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MMP13P45452 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MMP13P45452 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MMP13P45452 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MMP13P45452 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
MMP13P45452 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
MMP13P45452 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
MMP13P45452 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MMP13P45452 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
MMP13P45452 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MMP13P45452 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MMP13P45452 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MMP13P45452 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MMP13P45452 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MMP13P45452 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MMP13P45452 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MMP13P45452 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MMP13P45452 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MMP13P45452 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MMP13P45452 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MMP13P45452 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MMP13P45452 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MMP13P45452 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MMP13P45452 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MMP13P45452 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MMP13P45452 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MMP13P45452 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MMP13P45452 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MMP13P45452 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MMP13P45452 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MMP13P45452 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MMP13P45452 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MMP13P45452 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MMP13P45452 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MMP13P45452 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MMP13P45452 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MMP13P45452 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MMP13P45452 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
MMP13P45452 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MMP13P45452 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MMP13P45452 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MMP13P45452 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MMP13P45452 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MMP13P45452 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MMP13P45452 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MMP13P45452 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MMP13P45452 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MMP13P45452 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MMP13P45452 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MMP13P45452 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MMP13P45452 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MMP13P45452 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MMP13P45452 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
MMP13P45452 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MMP13P45452 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms