Protein–RNA interactions for Protein: P43351

RAD52, DNA repair protein RAD52 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD52P43351 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RAD52P43351 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RAD52P43351 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RAD52P43351 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RAD52P43351 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RAD52P43351 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RAD52P43351 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RAD52P43351 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RAD52P43351 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
RAD52P43351 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
RAD52P43351 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RAD52P43351 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RAD52P43351 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RAD52P43351 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RAD52P43351 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RAD52P43351 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RAD52P43351 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RAD52P43351 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RAD52P43351 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RAD52P43351 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RAD52P43351 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RAD52P43351 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RAD52P43351 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RAD52P43351 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RAD52P43351 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RAD52P43351 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RAD52P43351 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RAD52P43351 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RAD52P43351 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
RAD52P43351 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
RAD52P43351 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RAD52P43351 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RAD52P43351 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RAD52P43351 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RAD52P43351 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RAD52P43351 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RAD52P43351 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RAD52P43351 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RAD52P43351 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
RAD52P43351 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RAD52P43351 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RAD52P43351 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RAD52P43351 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RAD52P43351 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
RAD52P43351 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RAD52P43351 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RAD52P43351 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RAD52P43351 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RAD52P43351 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RAD52P43351 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RAD52P43351 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RAD52P43351 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RAD52P43351 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RAD52P43351 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RAD52P43351 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RAD52P43351 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RAD52P43351 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RAD52P43351 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RAD52P43351 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RAD52P43351 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
RAD52P43351 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RAD52P43351 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RAD52P43351 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RAD52P43351 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RAD52P43351 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RAD52P43351 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAD52P43351 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAD52P43351 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAD52P43351 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAD52P43351 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAD52P43351 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAD52P43351 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAD52P43351 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAD52P43351 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAD52P43351 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAD52P43351 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
RAD52P43351 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAD52P43351 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAD52P43351 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAD52P43351 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAD52P43351 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAD52P43351 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAD52P43351 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAD52P43351 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAD52P43351 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
RAD52P43351 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAD52P43351 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
RAD52P43351 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAD52P43351 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAD52P43351 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAD52P43351 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAD52P43351 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAD52P43351 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAD52P43351 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAD52P43351 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAD52P43351 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAD52P43351 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAD52P43351 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAD52P43351 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAD52P43351 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms