Protein–RNA interactions for Protein: P42127

ASIP, Agouti-signaling protein, humanhuman

Predictions only

Length 132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIPP42127 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ASIPP42127 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ASIPP42127 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ASIPP42127 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ASIPP42127 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ASIPP42127 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ASIPP42127 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ASIPP42127 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ASIPP42127 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ASIPP42127 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ASIPP42127 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ASIPP42127 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ASIPP42127 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ASIPP42127 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ASIPP42127 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ASIPP42127 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ASIPP42127 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ASIPP42127 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ASIPP42127 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ASIPP42127 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ASIPP42127 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ASIPP42127 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ASIPP42127 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ASIPP42127 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ASIPP42127 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ASIPP42127 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ASIPP42127 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ASIPP42127 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ASIPP42127 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ASIPP42127 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ASIPP42127 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ASIPP42127 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ASIPP42127 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ASIPP42127 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ASIPP42127 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ASIPP42127 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ASIPP42127 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ASIPP42127 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ASIPP42127 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ASIPP42127 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ASIPP42127 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ASIPP42127 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ASIPP42127 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ASIPP42127 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ASIPP42127 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ASIPP42127 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ASIPP42127 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ASIPP42127 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ASIPP42127 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ASIPP42127 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ASIPP42127 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ASIPP42127 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ASIPP42127 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ASIPP42127 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ASIPP42127 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ASIPP42127 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ASIPP42127 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ASIPP42127 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ASIPP42127 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ASIPP42127 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
ASIPP42127 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
ASIPP42127 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
ASIPP42127 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ASIPP42127 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ASIPP42127 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ASIPP42127 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ASIPP42127 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ASIPP42127 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ASIPP42127 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ASIPP42127 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ASIPP42127 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ASIPP42127 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ASIPP42127 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ASIPP42127 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ASIPP42127 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ASIPP42127 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ASIPP42127 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ASIPP42127 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ASIPP42127 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ASIPP42127 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ASIPP42127 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ASIPP42127 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ASIPP42127 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ASIPP42127 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ASIPP42127 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ASIPP42127 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ASIPP42127 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ASIPP42127 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ASIPP42127 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ASIPP42127 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ASIPP42127 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ASIPP42127 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ASIPP42127 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ASIPP42127 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ASIPP42127 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ASIPP42127 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ASIPP42127 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ASIPP42127 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ASIPP42127 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ASIPP42127 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms