Protein–RNA interactions for Protein: P40818

USP8, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP8P40818 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
USP8P40818 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP8P40818 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP8P40818 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP8P40818 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP8P40818 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP8P40818 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP8P40818 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP8P40818 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP8P40818 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP8P40818 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
USP8P40818 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP8P40818 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP8P40818 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP8P40818 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP8P40818 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP8P40818 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP8P40818 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP8P40818 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP8P40818 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP8P40818 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP8P40818 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP8P40818 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP8P40818 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP8P40818 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP8P40818 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP8P40818 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
USP8P40818 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP8P40818 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP8P40818 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP8P40818 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP8P40818 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP8P40818 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP8P40818 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP8P40818 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP8P40818 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP8P40818 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
USP8P40818 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
USP8P40818 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
USP8P40818 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP8P40818 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP8P40818 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP8P40818 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP8P40818 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP8P40818 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP8P40818 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP8P40818 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP8P40818 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP8P40818 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP8P40818 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP8P40818 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP8P40818 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP8P40818 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP8P40818 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP8P40818 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP8P40818 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP8P40818 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP8P40818 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
USP8P40818 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP8P40818 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP8P40818 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP8P40818 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP8P40818 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP8P40818 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP8P40818 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP8P40818 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
USP8P40818 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP8P40818 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP8P40818 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP8P40818 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP8P40818 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP8P40818 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP8P40818 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP8P40818 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP8P40818 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
USP8P40818 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP8P40818 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP8P40818 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP8P40818 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP8P40818 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP8P40818 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP8P40818 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP8P40818 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP8P40818 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP8P40818 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
USP8P40818 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP8P40818 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP8P40818 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP8P40818 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP8P40818 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP8P40818 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
USP8P40818 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP8P40818 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP8P40818 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP8P40818 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
USP8P40818 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
USP8P40818 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
USP8P40818 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
USP8P40818 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
USP8P40818 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms