Protein–RNA interactions for Protein: P40429

RPL13A, 60S ribosomal protein L13a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL13AP40429 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPL13AP40429 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPL13AP40429 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPL13AP40429 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPL13AP40429 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPL13AP40429 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RPL13AP40429 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPL13AP40429 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPL13AP40429 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPL13AP40429 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPL13AP40429 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPL13AP40429 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPL13AP40429 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPL13AP40429 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPL13AP40429 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPL13AP40429 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPL13AP40429 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPL13AP40429 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPL13AP40429 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPL13AP40429 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPL13AP40429 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPL13AP40429 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPL13AP40429 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPL13AP40429 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPL13AP40429 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPL13AP40429 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPL13AP40429 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPL13AP40429 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPL13AP40429 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPL13AP40429 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPL13AP40429 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPL13AP40429 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPL13AP40429 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RPL13AP40429 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPL13AP40429 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPL13AP40429 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPL13AP40429 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPL13AP40429 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPL13AP40429 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPL13AP40429 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPL13AP40429 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPL13AP40429 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPL13AP40429 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPL13AP40429 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPL13AP40429 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPL13AP40429 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPL13AP40429 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPL13AP40429 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPL13AP40429 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPL13AP40429 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPL13AP40429 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPL13AP40429 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPL13AP40429 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPL13AP40429 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPL13AP40429 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPL13AP40429 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPL13AP40429 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPL13AP40429 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPL13AP40429 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPL13AP40429 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPL13AP40429 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPL13AP40429 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPL13AP40429 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPL13AP40429 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPL13AP40429 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPL13AP40429 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPL13AP40429 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPL13AP40429 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPL13AP40429 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPL13AP40429 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPL13AP40429 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPL13AP40429 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPL13AP40429 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPL13AP40429 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPL13AP40429 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPL13AP40429 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPL13AP40429 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPL13AP40429 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPL13AP40429 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPL13AP40429 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPL13AP40429 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPL13AP40429 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPL13AP40429 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RPL13AP40429 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RPL13AP40429 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RPL13AP40429 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RPL13AP40429 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RPL13AP40429 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RPL13AP40429 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPL13AP40429 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPL13AP40429 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
RPL13AP40429 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPL13AP40429 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RPL13AP40429 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RPL13AP40429 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPL13AP40429 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
RPL13AP40429 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPL13AP40429 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RPL13AP40429 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RPL13AP40429 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms