Protein–RNA interactions for Protein: P38117

ETFB, Electron transfer flavoprotein subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETFBP38117 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ETFBP38117 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ETFBP38117 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ETFBP38117 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ETFBP38117 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ETFBP38117 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ETFBP38117 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ETFBP38117 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ETFBP38117 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ETFBP38117 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ETFBP38117 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ETFBP38117 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ETFBP38117 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ETFBP38117 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ETFBP38117 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ETFBP38117 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ETFBP38117 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ETFBP38117 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ETFBP38117 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ETFBP38117 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ETFBP38117 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ETFBP38117 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ETFBP38117 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ETFBP38117 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ETFBP38117 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ETFBP38117 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ETFBP38117 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ETFBP38117 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ETFBP38117 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ETFBP38117 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ETFBP38117 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ETFBP38117 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ETFBP38117 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ETFBP38117 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ETFBP38117 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ETFBP38117 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ETFBP38117 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ETFBP38117 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ETFBP38117 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ETFBP38117 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ETFBP38117 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ETFBP38117 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ETFBP38117 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ETFBP38117 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ETFBP38117 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ETFBP38117 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ETFBP38117 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ETFBP38117 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ETFBP38117 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ETFBP38117 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ETFBP38117 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ETFBP38117 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ETFBP38117 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ETFBP38117 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ETFBP38117 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ETFBP38117 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ETFBP38117 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ETFBP38117 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ETFBP38117 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ETFBP38117 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ETFBP38117 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ETFBP38117 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ETFBP38117 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ETFBP38117 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ETFBP38117 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ETFBP38117 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ETFBP38117 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ETFBP38117 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ETFBP38117 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ETFBP38117 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ETFBP38117 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ETFBP38117 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ETFBP38117 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ETFBP38117 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ETFBP38117 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ETFBP38117 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ETFBP38117 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ETFBP38117 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ETFBP38117 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ETFBP38117 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ETFBP38117 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ETFBP38117 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ETFBP38117 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ETFBP38117 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ETFBP38117 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ETFBP38117 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ETFBP38117 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ETFBP38117 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ETFBP38117 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ETFBP38117 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ETFBP38117 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ETFBP38117 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ETFBP38117 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ETFBP38117 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ETFBP38117 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ETFBP38117 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ETFBP38117 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ETFBP38117 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ETFBP38117 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ETFBP38117 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms