Protein–RNA interactions for Protein: P35638

DDIT3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT3P35638 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DDIT3P35638 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DDIT3P35638 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
DDIT3P35638 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DDIT3P35638 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DDIT3P35638 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
DDIT3P35638 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
DDIT3P35638 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
DDIT3P35638 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
DDIT3P35638 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
DDIT3P35638 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DDIT3P35638 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DDIT3P35638 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
DDIT3P35638 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DDIT3P35638 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
DDIT3P35638 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
DDIT3P35638 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
DDIT3P35638 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
DDIT3P35638 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
DDIT3P35638 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
DDIT3P35638 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
DDIT3P35638 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
DDIT3P35638 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
DDIT3P35638 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
DDIT3P35638 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
DDIT3P35638 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
DDIT3P35638 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DDIT3P35638 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
DDIT3P35638 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
DDIT3P35638 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DDIT3P35638 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DDIT3P35638 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
DDIT3P35638 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DDIT3P35638 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DDIT3P35638 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DDIT3P35638 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DDIT3P35638 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DDIT3P35638 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
DDIT3P35638 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DDIT3P35638 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
DDIT3P35638 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
DDIT3P35638 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
DDIT3P35638 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DDIT3P35638 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DDIT3P35638 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DDIT3P35638 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DDIT3P35638 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DDIT3P35638 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
DDIT3P35638 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DDIT3P35638 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
DDIT3P35638 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DDIT3P35638 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DDIT3P35638 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DDIT3P35638 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DDIT3P35638 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
DDIT3P35638 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
DDIT3P35638 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
DDIT3P35638 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
DDIT3P35638 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
DDIT3P35638 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
DDIT3P35638 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
DDIT3P35638 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
DDIT3P35638 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
DDIT3P35638 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
DDIT3P35638 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
DDIT3P35638 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
DDIT3P35638 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
DDIT3P35638 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
DDIT3P35638 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
DDIT3P35638 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
DDIT3P35638 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
DDIT3P35638 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DDIT3P35638 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DDIT3P35638 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DDIT3P35638 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DDIT3P35638 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DDIT3P35638 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DDIT3P35638 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DDIT3P35638 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DDIT3P35638 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DDIT3P35638 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DDIT3P35638 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DDIT3P35638 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DDIT3P35638 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
DDIT3P35638 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DDIT3P35638 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
DDIT3P35638 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DDIT3P35638 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
DDIT3P35638 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
DDIT3P35638 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DDIT3P35638 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DDIT3P35638 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DDIT3P35638 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DDIT3P35638 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DDIT3P35638 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DDIT3P35638 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DDIT3P35638 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DDIT3P35638 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DDIT3P35638 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DDIT3P35638 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms