Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACTN2P35609 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACTN2P35609 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACTN2P35609 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACTN2P35609 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACTN2P35609 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACTN2P35609 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACTN2P35609 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACTN2P35609 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACTN2P35609 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACTN2P35609 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACTN2P35609 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ACTN2P35609 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACTN2P35609 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACTN2P35609 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ACTN2P35609 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACTN2P35609 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACTN2P35609 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACTN2P35609 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACTN2P35609 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACTN2P35609 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACTN2P35609 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACTN2P35609 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACTN2P35609 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACTN2P35609 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACTN2P35609 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACTN2P35609 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACTN2P35609 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACTN2P35609 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACTN2P35609 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACTN2P35609 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACTN2P35609 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACTN2P35609 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACTN2P35609 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACTN2P35609 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACTN2P35609 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACTN2P35609 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACTN2P35609 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACTN2P35609 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACTN2P35609 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACTN2P35609 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACTN2P35609 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACTN2P35609 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACTN2P35609 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACTN2P35609 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACTN2P35609 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACTN2P35609 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACTN2P35609 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACTN2P35609 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACTN2P35609 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACTN2P35609 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACTN2P35609 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACTN2P35609 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACTN2P35609 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACTN2P35609 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACTN2P35609 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACTN2P35609 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACTN2P35609 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACTN2P35609 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACTN2P35609 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ACTN2P35609 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ACTN2P35609 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ACTN2P35609 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACTN2P35609 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACTN2P35609 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACTN2P35609 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ACTN2P35609 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACTN2P35609 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACTN2P35609 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACTN2P35609 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACTN2P35609 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACTN2P35609 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACTN2P35609 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACTN2P35609 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACTN2P35609 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACTN2P35609 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACTN2P35609 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACTN2P35609 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACTN2P35609 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACTN2P35609 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACTN2P35609 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACTN2P35609 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACTN2P35609 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACTN2P35609 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACTN2P35609 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACTN2P35609 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACTN2P35609 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACTN2P35609 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACTN2P35609 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACTN2P35609 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACTN2P35609 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACTN2P35609 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACTN2P35609 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACTN2P35609 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACTN2P35609 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACTN2P35609 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACTN2P35609 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACTN2P35609 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACTN2P35609 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACTN2P35609 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms