Protein–RNA interactions for Protein: P33076

CIITA, MHC class II transactivator, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIITAP33076 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CIITAP33076 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CIITAP33076 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CIITAP33076 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CIITAP33076 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CIITAP33076 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CIITAP33076 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CIITAP33076 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CIITAP33076 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CIITAP33076 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CIITAP33076 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CIITAP33076 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CIITAP33076 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CIITAP33076 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CIITAP33076 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CIITAP33076 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CIITAP33076 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CIITAP33076 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CIITAP33076 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CIITAP33076 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CIITAP33076 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CIITAP33076 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CIITAP33076 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CIITAP33076 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CIITAP33076 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CIITAP33076 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CIITAP33076 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CIITAP33076 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CIITAP33076 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CIITAP33076 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CIITAP33076 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CIITAP33076 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CIITAP33076 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CIITAP33076 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CIITAP33076 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CIITAP33076 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CIITAP33076 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CIITAP33076 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CIITAP33076 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CIITAP33076 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CIITAP33076 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CIITAP33076 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CIITAP33076 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CIITAP33076 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CIITAP33076 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CIITAP33076 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CIITAP33076 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CIITAP33076 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CIITAP33076 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CIITAP33076 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CIITAP33076 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CIITAP33076 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CIITAP33076 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CIITAP33076 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CIITAP33076 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CIITAP33076 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CIITAP33076 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CIITAP33076 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CIITAP33076 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CIITAP33076 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CIITAP33076 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CIITAP33076 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CIITAP33076 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CIITAP33076 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CIITAP33076 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CIITAP33076 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CIITAP33076 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CIITAP33076 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CIITAP33076 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CIITAP33076 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CIITAP33076 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CIITAP33076 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CIITAP33076 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CIITAP33076 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CIITAP33076 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CIITAP33076 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CIITAP33076 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CIITAP33076 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CIITAP33076 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CIITAP33076 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CIITAP33076 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CIITAP33076 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CIITAP33076 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CIITAP33076 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CIITAP33076 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CIITAP33076 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CIITAP33076 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CIITAP33076 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CIITAP33076 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CIITAP33076 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CIITAP33076 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CIITAP33076 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CIITAP33076 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CIITAP33076 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CIITAP33076 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CIITAP33076 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CIITAP33076 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CIITAP33076 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CIITAP33076 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CIITAP33076 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms