Protein–RNA interactions for Protein: P30085

CMPK1, UMP-CMP kinase, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMPK1P30085 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CMPK1P30085 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CMPK1P30085 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CMPK1P30085 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CMPK1P30085 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CMPK1P30085 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CMPK1P30085 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CMPK1P30085 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CMPK1P30085 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CMPK1P30085 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CMPK1P30085 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CMPK1P30085 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CMPK1P30085 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CMPK1P30085 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CMPK1P30085 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CMPK1P30085 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
CMPK1P30085 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CMPK1P30085 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CMPK1P30085 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CMPK1P30085 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CMPK1P30085 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CMPK1P30085 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CMPK1P30085 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CMPK1P30085 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CMPK1P30085 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CMPK1P30085 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CMPK1P30085 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CMPK1P30085 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CMPK1P30085 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CMPK1P30085 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CMPK1P30085 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CMPK1P30085 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CMPK1P30085 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CMPK1P30085 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CMPK1P30085 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CMPK1P30085 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CMPK1P30085 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CMPK1P30085 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CMPK1P30085 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CMPK1P30085 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CMPK1P30085 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CMPK1P30085 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CMPK1P30085 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CMPK1P30085 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CMPK1P30085 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CMPK1P30085 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CMPK1P30085 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CMPK1P30085 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CMPK1P30085 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CMPK1P30085 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CMPK1P30085 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CMPK1P30085 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CMPK1P30085 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CMPK1P30085 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CMPK1P30085 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CMPK1P30085 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CMPK1P30085 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CMPK1P30085 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CMPK1P30085 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CMPK1P30085 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CMPK1P30085 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CMPK1P30085 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CMPK1P30085 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CMPK1P30085 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CMPK1P30085 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CMPK1P30085 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CMPK1P30085 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CMPK1P30085 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CMPK1P30085 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CMPK1P30085 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CMPK1P30085 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CMPK1P30085 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CMPK1P30085 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CMPK1P30085 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CMPK1P30085 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CMPK1P30085 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CMPK1P30085 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CMPK1P30085 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CMPK1P30085 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CMPK1P30085 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CMPK1P30085 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CMPK1P30085 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CMPK1P30085 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CMPK1P30085 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CMPK1P30085 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CMPK1P30085 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
CMPK1P30085 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CMPK1P30085 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CMPK1P30085 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CMPK1P30085 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CMPK1P30085 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CMPK1P30085 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CMPK1P30085 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CMPK1P30085 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CMPK1P30085 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CMPK1P30085 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CMPK1P30085 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CMPK1P30085 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CMPK1P30085 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CMPK1P30085 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms