Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SSFA2P28290 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SSFA2P28290 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SSFA2P28290 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SSFA2P28290 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SSFA2P28290 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SSFA2P28290 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SSFA2P28290 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SSFA2P28290 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SSFA2P28290 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SSFA2P28290 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SSFA2P28290 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SSFA2P28290 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SSFA2P28290 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SSFA2P28290 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SSFA2P28290 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SSFA2P28290 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SSFA2P28290 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SSFA2P28290 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SSFA2P28290 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SSFA2P28290 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SSFA2P28290 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SSFA2P28290 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SSFA2P28290 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SSFA2P28290 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
SSFA2P28290 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SSFA2P28290 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SSFA2P28290 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SSFA2P28290 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SSFA2P28290 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SSFA2P28290 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SSFA2P28290 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SSFA2P28290 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SSFA2P28290 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
SSFA2P28290 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SSFA2P28290 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
SSFA2P28290 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
SSFA2P28290 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SSFA2P28290 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SSFA2P28290 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SSFA2P28290 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SSFA2P28290 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SSFA2P28290 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
SSFA2P28290 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
SSFA2P28290 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SSFA2P28290 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
SSFA2P28290 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SSFA2P28290 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SSFA2P28290 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SSFA2P28290 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SSFA2P28290 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SSFA2P28290 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SSFA2P28290 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SSFA2P28290 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
SSFA2P28290 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SSFA2P28290 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SSFA2P28290 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SSFA2P28290 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SSFA2P28290 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SSFA2P28290 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
SSFA2P28290 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SSFA2P28290 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SSFA2P28290 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SSFA2P28290 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SSFA2P28290 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SSFA2P28290 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
SSFA2P28290 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SSFA2P28290 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SSFA2P28290 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SSFA2P28290 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SSFA2P28290 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SSFA2P28290 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SSFA2P28290 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SSFA2P28290 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SSFA2P28290 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
SSFA2P28290 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SSFA2P28290 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SSFA2P28290 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SSFA2P28290 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SSFA2P28290 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SSFA2P28290 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SSFA2P28290 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SSFA2P28290 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SSFA2P28290 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SSFA2P28290 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SSFA2P28290 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SSFA2P28290 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
SSFA2P28290 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SSFA2P28290 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SSFA2P28290 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SSFA2P28290 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SSFA2P28290 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SSFA2P28290 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SSFA2P28290 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SSFA2P28290 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SSFA2P28290 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SSFA2P28290 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SSFA2P28290 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SSFA2P28290 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
SSFA2P28290 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms