Protein–RNA interactions for Protein: P26045

PTPN3, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 3, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN3P26045 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPN3P26045 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPN3P26045 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPN3P26045 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPN3P26045 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPN3P26045 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPN3P26045 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPN3P26045 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPN3P26045 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPN3P26045 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPN3P26045 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPN3P26045 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPN3P26045 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPN3P26045 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPN3P26045 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPN3P26045 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPN3P26045 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPN3P26045 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPN3P26045 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPN3P26045 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPN3P26045 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPN3P26045 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPN3P26045 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPN3P26045 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPN3P26045 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPN3P26045 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPN3P26045 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPN3P26045 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPN3P26045 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPN3P26045 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPN3P26045 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPN3P26045 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPN3P26045 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPN3P26045 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPN3P26045 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPN3P26045 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPN3P26045 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPN3P26045 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPN3P26045 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPN3P26045 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPN3P26045 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPN3P26045 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPN3P26045 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPN3P26045 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPN3P26045 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPN3P26045 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPN3P26045 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPN3P26045 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPN3P26045 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPN3P26045 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPN3P26045 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPN3P26045 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPN3P26045 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPN3P26045 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPN3P26045 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPN3P26045 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPN3P26045 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPN3P26045 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPN3P26045 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPN3P26045 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPN3P26045 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPN3P26045 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPN3P26045 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPN3P26045 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPN3P26045 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPN3P26045 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPN3P26045 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPN3P26045 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPN3P26045 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPN3P26045 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPN3P26045 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPN3P26045 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PTPN3P26045 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PTPN3P26045 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PTPN3P26045 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPN3P26045 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPN3P26045 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPN3P26045 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPN3P26045 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPN3P26045 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPN3P26045 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPN3P26045 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPN3P26045 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPN3P26045 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPN3P26045 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPN3P26045 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPN3P26045 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPN3P26045 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPN3P26045 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPN3P26045 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPN3P26045 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPN3P26045 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPN3P26045 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPN3P26045 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPN3P26045 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPN3P26045 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPN3P26045 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPN3P26045 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPN3P26045 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPN3P26045 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms