Protein–RNA interactions for Protein: P24863

CCNC, Cyclin-C, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNCP24863 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNCP24863 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNCP24863 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNCP24863 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNCP24863 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNCP24863 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNCP24863 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNCP24863 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNCP24863 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CCNCP24863 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNCP24863 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNCP24863 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNCP24863 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNCP24863 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNCP24863 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNCP24863 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNCP24863 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNCP24863 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNCP24863 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNCP24863 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNCP24863 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNCP24863 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNCP24863 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNCP24863 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNCP24863 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNCP24863 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNCP24863 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNCP24863 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNCP24863 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNCP24863 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNCP24863 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNCP24863 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNCP24863 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNCP24863 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNCP24863 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCNCP24863 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCNCP24863 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCNCP24863 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCNCP24863 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCNCP24863 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCNCP24863 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCNCP24863 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCNCP24863 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCNCP24863 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCNCP24863 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCNCP24863 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCNCP24863 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCNCP24863 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CCNCP24863 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCNCP24863 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCNCP24863 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCNCP24863 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCNCP24863 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
CCNCP24863 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCNCP24863 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCNCP24863 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCNCP24863 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCNCP24863 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCNCP24863 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCNCP24863 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCNCP24863 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCNCP24863 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCNCP24863 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCNCP24863 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CCNCP24863 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCNCP24863 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCNCP24863 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCNCP24863 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CCNCP24863 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCNCP24863 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCNCP24863 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCNCP24863 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CCNCP24863 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCNCP24863 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCNCP24863 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCNCP24863 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCNCP24863 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCNCP24863 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCNCP24863 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCNCP24863 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCNCP24863 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CCNCP24863 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCNCP24863 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCNCP24863 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCNCP24863 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCNCP24863 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCNCP24863 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCNCP24863 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCNCP24863 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCNCP24863 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCNCP24863 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCNCP24863 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCNCP24863 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCNCP24863 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCNCP24863 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCNCP24863 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCNCP24863 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCNCP24863 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCNCP24863 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CCNCP24863 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms