Protein–RNA interactions for Protein: P23025

XPA, DNA repair protein complementing XP-A cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPAP23025 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
XPAP23025 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
XPAP23025 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
XPAP23025 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
XPAP23025 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
XPAP23025 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
XPAP23025 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
XPAP23025 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
XPAP23025 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
XPAP23025 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
XPAP23025 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
XPAP23025 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
XPAP23025 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
XPAP23025 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
XPAP23025 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
XPAP23025 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
XPAP23025 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
XPAP23025 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
XPAP23025 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
XPAP23025 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
XPAP23025 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
XPAP23025 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
XPAP23025 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
XPAP23025 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
XPAP23025 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
XPAP23025 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
XPAP23025 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
XPAP23025 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
XPAP23025 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
XPAP23025 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
XPAP23025 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
XPAP23025 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
XPAP23025 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
XPAP23025 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
XPAP23025 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
XPAP23025 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
XPAP23025 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
XPAP23025 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
XPAP23025 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
XPAP23025 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
XPAP23025 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
XPAP23025 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
XPAP23025 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
XPAP23025 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
XPAP23025 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
XPAP23025 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
XPAP23025 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
XPAP23025 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
XPAP23025 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
XPAP23025 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
XPAP23025 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
XPAP23025 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
XPAP23025 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
XPAP23025 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
XPAP23025 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
XPAP23025 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
XPAP23025 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
XPAP23025 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
XPAP23025 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
XPAP23025 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
XPAP23025 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
XPAP23025 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
XPAP23025 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
XPAP23025 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
XPAP23025 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
XPAP23025 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
XPAP23025 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
XPAP23025 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
XPAP23025 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
XPAP23025 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
XPAP23025 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
XPAP23025 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
XPAP23025 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
XPAP23025 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
XPAP23025 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
XPAP23025 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
XPAP23025 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
XPAP23025 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
XPAP23025 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
XPAP23025 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
XPAP23025 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
XPAP23025 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
XPAP23025 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
XPAP23025 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
XPAP23025 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
XPAP23025 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
XPAP23025 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
XPAP23025 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
XPAP23025 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
XPAP23025 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
XPAP23025 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
XPAP23025 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
XPAP23025 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
XPAP23025 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
XPAP23025 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
XPAP23025 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
XPAP23025 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
XPAP23025 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
XPAP23025 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
XPAP23025 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms