Protein–RNA interactions for Protein: P21399

ACO1, Cytoplasmic aconitate hydratase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACO1P21399 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACO1P21399 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACO1P21399 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACO1P21399 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACO1P21399 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACO1P21399 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACO1P21399 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACO1P21399 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACO1P21399 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACO1P21399 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACO1P21399 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACO1P21399 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACO1P21399 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACO1P21399 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACO1P21399 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACO1P21399 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACO1P21399 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACO1P21399 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ACO1P21399 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACO1P21399 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACO1P21399 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACO1P21399 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ACO1P21399 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ACO1P21399 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ACO1P21399 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ACO1P21399 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ACO1P21399 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ACO1P21399 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ACO1P21399 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACO1P21399 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACO1P21399 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACO1P21399 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACO1P21399 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ACO1P21399 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACO1P21399 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACO1P21399 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACO1P21399 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACO1P21399 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACO1P21399 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACO1P21399 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ACO1P21399 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACO1P21399 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACO1P21399 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACO1P21399 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACO1P21399 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACO1P21399 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACO1P21399 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACO1P21399 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ACO1P21399 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ACO1P21399 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ACO1P21399 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACO1P21399 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACO1P21399 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACO1P21399 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ACO1P21399 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACO1P21399 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACO1P21399 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACO1P21399 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ACO1P21399 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACO1P21399 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACO1P21399 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACO1P21399 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACO1P21399 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACO1P21399 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACO1P21399 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACO1P21399 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACO1P21399 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACO1P21399 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACO1P21399 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACO1P21399 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACO1P21399 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACO1P21399 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACO1P21399 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ACO1P21399 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACO1P21399 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACO1P21399 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACO1P21399 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACO1P21399 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACO1P21399 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ACO1P21399 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ACO1P21399 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACO1P21399 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACO1P21399 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACO1P21399 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACO1P21399 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACO1P21399 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACO1P21399 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACO1P21399 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACO1P21399 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACO1P21399 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACO1P21399 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACO1P21399 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACO1P21399 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACO1P21399 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ACO1P21399 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACO1P21399 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACO1P21399 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACO1P21399 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACO1P21399 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACO1P21399 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms