Protein–RNA interactions for Protein: P20783

NTF3, Neurotrophin-3, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTF3P20783 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NTF3P20783 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NTF3P20783 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NTF3P20783 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NTF3P20783 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NTF3P20783 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NTF3P20783 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NTF3P20783 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NTF3P20783 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NTF3P20783 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NTF3P20783 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NTF3P20783 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NTF3P20783 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NTF3P20783 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NTF3P20783 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NTF3P20783 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NTF3P20783 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NTF3P20783 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NTF3P20783 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NTF3P20783 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NTF3P20783 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NTF3P20783 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NTF3P20783 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NTF3P20783 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NTF3P20783 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NTF3P20783 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NTF3P20783 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NTF3P20783 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NTF3P20783 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NTF3P20783 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NTF3P20783 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NTF3P20783 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NTF3P20783 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NTF3P20783 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NTF3P20783 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NTF3P20783 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NTF3P20783 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NTF3P20783 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NTF3P20783 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NTF3P20783 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NTF3P20783 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NTF3P20783 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NTF3P20783 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NTF3P20783 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NTF3P20783 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NTF3P20783 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NTF3P20783 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NTF3P20783 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NTF3P20783 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NTF3P20783 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NTF3P20783 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NTF3P20783 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NTF3P20783 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NTF3P20783 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NTF3P20783 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NTF3P20783 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NTF3P20783 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NTF3P20783 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NTF3P20783 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NTF3P20783 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NTF3P20783 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NTF3P20783 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NTF3P20783 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NTF3P20783 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NTF3P20783 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NTF3P20783 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NTF3P20783 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NTF3P20783 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NTF3P20783 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NTF3P20783 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NTF3P20783 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NTF3P20783 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NTF3P20783 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NTF3P20783 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NTF3P20783 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NTF3P20783 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NTF3P20783 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NTF3P20783 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NTF3P20783 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NTF3P20783 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NTF3P20783 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NTF3P20783 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NTF3P20783 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NTF3P20783 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NTF3P20783 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NTF3P20783 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NTF3P20783 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NTF3P20783 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NTF3P20783 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NTF3P20783 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NTF3P20783 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NTF3P20783 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NTF3P20783 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NTF3P20783 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NTF3P20783 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NTF3P20783 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NTF3P20783 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NTF3P20783 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NTF3P20783 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NTF3P20783 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms