Protein–RNA interactions for Protein: P17861

XBP1, X-box-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XBP1P17861 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
XBP1P17861 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
XBP1P17861 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
XBP1P17861 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
XBP1P17861 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
XBP1P17861 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
XBP1P17861 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
XBP1P17861 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
XBP1P17861 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
XBP1P17861 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
XBP1P17861 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
XBP1P17861 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
XBP1P17861 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
XBP1P17861 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
XBP1P17861 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
XBP1P17861 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
XBP1P17861 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
XBP1P17861 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
XBP1P17861 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
XBP1P17861 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
XBP1P17861 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
XBP1P17861 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
XBP1P17861 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
XBP1P17861 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
XBP1P17861 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
XBP1P17861 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
XBP1P17861 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
XBP1P17861 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
XBP1P17861 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
XBP1P17861 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
XBP1P17861 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
XBP1P17861 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
XBP1P17861 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
XBP1P17861 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
XBP1P17861 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
XBP1P17861 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
XBP1P17861 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
XBP1P17861 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
XBP1P17861 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
XBP1P17861 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
XBP1P17861 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
XBP1P17861 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
XBP1P17861 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
XBP1P17861 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
XBP1P17861 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
XBP1P17861 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
XBP1P17861 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
XBP1P17861 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
XBP1P17861 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
XBP1P17861 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
XBP1P17861 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
XBP1P17861 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
XBP1P17861 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
XBP1P17861 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
XBP1P17861 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
XBP1P17861 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
XBP1P17861 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
XBP1P17861 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
XBP1P17861 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
XBP1P17861 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
XBP1P17861 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
XBP1P17861 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
XBP1P17861 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
XBP1P17861 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
XBP1P17861 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
XBP1P17861 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
XBP1P17861 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
XBP1P17861 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
XBP1P17861 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
XBP1P17861 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
XBP1P17861 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
XBP1P17861 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
XBP1P17861 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
XBP1P17861 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
XBP1P17861 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
XBP1P17861 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
XBP1P17861 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
XBP1P17861 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
XBP1P17861 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
XBP1P17861 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
XBP1P17861 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
XBP1P17861 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
XBP1P17861 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
XBP1P17861 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
XBP1P17861 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
XBP1P17861 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
XBP1P17861 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
XBP1P17861 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
XBP1P17861 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
XBP1P17861 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
XBP1P17861 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
XBP1P17861 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
XBP1P17861 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
XBP1P17861 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
XBP1P17861 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
XBP1P17861 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
XBP1P17861 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
XBP1P17861 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
XBP1P17861 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
XBP1P17861 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms