Protein–RNA interactions for Protein: P17655

CAPN2, Calpain-2 catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN2P17655 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CAPN2P17655 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CAPN2P17655 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CAPN2P17655 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CAPN2P17655 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CAPN2P17655 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CAPN2P17655 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CAPN2P17655 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CAPN2P17655 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CAPN2P17655 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CAPN2P17655 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CAPN2P17655 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CAPN2P17655 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CAPN2P17655 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CAPN2P17655 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CAPN2P17655 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CAPN2P17655 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CAPN2P17655 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CAPN2P17655 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CAPN2P17655 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CAPN2P17655 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CAPN2P17655 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CAPN2P17655 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CAPN2P17655 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CAPN2P17655 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CAPN2P17655 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CAPN2P17655 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CAPN2P17655 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CAPN2P17655 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CAPN2P17655 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CAPN2P17655 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CAPN2P17655 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CAPN2P17655 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CAPN2P17655 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CAPN2P17655 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CAPN2P17655 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CAPN2P17655 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CAPN2P17655 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CAPN2P17655 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CAPN2P17655 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CAPN2P17655 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CAPN2P17655 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CAPN2P17655 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CAPN2P17655 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CAPN2P17655 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CAPN2P17655 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CAPN2P17655 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CAPN2P17655 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CAPN2P17655 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CAPN2P17655 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CAPN2P17655 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CAPN2P17655 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CAPN2P17655 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CAPN2P17655 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CAPN2P17655 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CAPN2P17655 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CAPN2P17655 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CAPN2P17655 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CAPN2P17655 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CAPN2P17655 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CAPN2P17655 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CAPN2P17655 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CAPN2P17655 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CAPN2P17655 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CAPN2P17655 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CAPN2P17655 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CAPN2P17655 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CAPN2P17655 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CAPN2P17655 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CAPN2P17655 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CAPN2P17655 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CAPN2P17655 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CAPN2P17655 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CAPN2P17655 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CAPN2P17655 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CAPN2P17655 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CAPN2P17655 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CAPN2P17655 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CAPN2P17655 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CAPN2P17655 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CAPN2P17655 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CAPN2P17655 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CAPN2P17655 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CAPN2P17655 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CAPN2P17655 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CAPN2P17655 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CAPN2P17655 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CAPN2P17655 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CAPN2P17655 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CAPN2P17655 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CAPN2P17655 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CAPN2P17655 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CAPN2P17655 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CAPN2P17655 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CAPN2P17655 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CAPN2P17655 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CAPN2P17655 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CAPN2P17655 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CAPN2P17655 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CAPN2P17655 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms