Protein–RNA interactions for Protein: P17600

SYN1, Synapsin-1, humanhuman

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYN1P17600 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYN1P17600 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYN1P17600 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYN1P17600 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SYN1P17600 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYN1P17600 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYN1P17600 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYN1P17600 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYN1P17600 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SYN1P17600 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYN1P17600 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYN1P17600 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYN1P17600 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYN1P17600 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYN1P17600 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYN1P17600 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYN1P17600 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYN1P17600 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYN1P17600 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYN1P17600 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYN1P17600 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYN1P17600 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYN1P17600 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYN1P17600 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYN1P17600 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYN1P17600 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYN1P17600 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SYN1P17600 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYN1P17600 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYN1P17600 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYN1P17600 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYN1P17600 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYN1P17600 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYN1P17600 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYN1P17600 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYN1P17600 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYN1P17600 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYN1P17600 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYN1P17600 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYN1P17600 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYN1P17600 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYN1P17600 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SYN1P17600 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SYN1P17600 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SYN1P17600 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SYN1P17600 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SYN1P17600 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SYN1P17600 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SYN1P17600 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SYN1P17600 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SYN1P17600 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYN1P17600 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SYN1P17600 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYN1P17600 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYN1P17600 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYN1P17600 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYN1P17600 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYN1P17600 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYN1P17600 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYN1P17600 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYN1P17600 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYN1P17600 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYN1P17600 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYN1P17600 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYN1P17600 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SYN1P17600 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SYN1P17600 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYN1P17600 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYN1P17600 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYN1P17600 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYN1P17600 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYN1P17600 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYN1P17600 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYN1P17600 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYN1P17600 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYN1P17600 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYN1P17600 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SYN1P17600 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SYN1P17600 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYN1P17600 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYN1P17600 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SYN1P17600 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYN1P17600 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYN1P17600 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYN1P17600 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYN1P17600 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYN1P17600 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYN1P17600 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYN1P17600 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SYN1P17600 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYN1P17600 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYN1P17600 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYN1P17600 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYN1P17600 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYN1P17600 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYN1P17600 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYN1P17600 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYN1P17600 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYN1P17600 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYN1P17600 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms