Protein–RNA interactions for Protein: P15498

VAV1, Proto-oncogene vav, humanhuman

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV1P15498 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VAV1P15498 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VAV1P15498 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
VAV1P15498 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VAV1P15498 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VAV1P15498 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VAV1P15498 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
VAV1P15498 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VAV1P15498 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VAV1P15498 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VAV1P15498 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VAV1P15498 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VAV1P15498 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VAV1P15498 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VAV1P15498 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VAV1P15498 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VAV1P15498 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VAV1P15498 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VAV1P15498 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VAV1P15498 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VAV1P15498 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VAV1P15498 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VAV1P15498 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VAV1P15498 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VAV1P15498 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VAV1P15498 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VAV1P15498 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VAV1P15498 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VAV1P15498 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VAV1P15498 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VAV1P15498 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VAV1P15498 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VAV1P15498 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VAV1P15498 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VAV1P15498 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VAV1P15498 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VAV1P15498 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VAV1P15498 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VAV1P15498 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
VAV1P15498 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VAV1P15498 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VAV1P15498 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VAV1P15498 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VAV1P15498 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VAV1P15498 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VAV1P15498 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VAV1P15498 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VAV1P15498 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VAV1P15498 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VAV1P15498 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VAV1P15498 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VAV1P15498 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
VAV1P15498 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VAV1P15498 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
VAV1P15498 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VAV1P15498 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
VAV1P15498 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VAV1P15498 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VAV1P15498 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VAV1P15498 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VAV1P15498 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VAV1P15498 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VAV1P15498 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VAV1P15498 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VAV1P15498 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VAV1P15498 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VAV1P15498 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VAV1P15498 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VAV1P15498 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VAV1P15498 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VAV1P15498 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VAV1P15498 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VAV1P15498 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VAV1P15498 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VAV1P15498 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VAV1P15498 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VAV1P15498 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VAV1P15498 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VAV1P15498 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VAV1P15498 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
VAV1P15498 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VAV1P15498 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VAV1P15498 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VAV1P15498 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VAV1P15498 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
VAV1P15498 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VAV1P15498 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VAV1P15498 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
VAV1P15498 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
VAV1P15498 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
VAV1P15498 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VAV1P15498 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VAV1P15498 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
VAV1P15498 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
VAV1P15498 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
VAV1P15498 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
VAV1P15498 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
VAV1P15498 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
VAV1P15498 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VAV1P15498 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms