Protein–RNA interactions for Protein: P13073

COX4I1, Cytochrome c oxidase subunit 4 isoform 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX4I1P13073 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
COX4I1P13073 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
COX4I1P13073 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
COX4I1P13073 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
COX4I1P13073 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
COX4I1P13073 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
COX4I1P13073 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
COX4I1P13073 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
COX4I1P13073 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
COX4I1P13073 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
COX4I1P13073 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
COX4I1P13073 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
COX4I1P13073 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
COX4I1P13073 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
COX4I1P13073 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
COX4I1P13073 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
COX4I1P13073 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
COX4I1P13073 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
COX4I1P13073 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
COX4I1P13073 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
COX4I1P13073 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
COX4I1P13073 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
COX4I1P13073 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
COX4I1P13073 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
COX4I1P13073 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
COX4I1P13073 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
COX4I1P13073 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
COX4I1P13073 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
COX4I1P13073 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
COX4I1P13073 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
COX4I1P13073 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
COX4I1P13073 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
COX4I1P13073 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
COX4I1P13073 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
COX4I1P13073 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
COX4I1P13073 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
COX4I1P13073 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
COX4I1P13073 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
COX4I1P13073 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
COX4I1P13073 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
COX4I1P13073 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
COX4I1P13073 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
COX4I1P13073 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
COX4I1P13073 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
COX4I1P13073 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
COX4I1P13073 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
COX4I1P13073 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
COX4I1P13073 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
COX4I1P13073 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
COX4I1P13073 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
COX4I1P13073 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
COX4I1P13073 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
COX4I1P13073 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
COX4I1P13073 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
COX4I1P13073 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
COX4I1P13073 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
COX4I1P13073 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
COX4I1P13073 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
COX4I1P13073 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
COX4I1P13073 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
COX4I1P13073 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
COX4I1P13073 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
COX4I1P13073 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
COX4I1P13073 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
COX4I1P13073 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
COX4I1P13073 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
COX4I1P13073 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
COX4I1P13073 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
COX4I1P13073 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
COX4I1P13073 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
COX4I1P13073 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
COX4I1P13073 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
COX4I1P13073 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
COX4I1P13073 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
COX4I1P13073 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
COX4I1P13073 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
COX4I1P13073 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
COX4I1P13073 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
COX4I1P13073 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
COX4I1P13073 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
COX4I1P13073 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
COX4I1P13073 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
COX4I1P13073 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
COX4I1P13073 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
COX4I1P13073 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
COX4I1P13073 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
COX4I1P13073 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
COX4I1P13073 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
COX4I1P13073 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
COX4I1P13073 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
COX4I1P13073 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
COX4I1P13073 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
COX4I1P13073 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
COX4I1P13073 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
COX4I1P13073 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
COX4I1P13073 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
COX4I1P13073 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
COX4I1P13073 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
COX4I1P13073 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
COX4I1P13073 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms