Protein–RNA interactions for Protein: P0DMQ9

C8orf89, Putative uncharacterized protein C8orf89, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf89P0DMQ9 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
C8orf89P0DMQ9 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
C8orf89P0DMQ9 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
C8orf89P0DMQ9 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
C8orf89P0DMQ9 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
C8orf89P0DMQ9 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
C8orf89P0DMQ9 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
C8orf89P0DMQ9 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
C8orf89P0DMQ9 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
C8orf89P0DMQ9 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
C8orf89P0DMQ9 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
C8orf89P0DMQ9 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
C8orf89P0DMQ9 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
C8orf89P0DMQ9 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
C8orf89P0DMQ9 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
C8orf89P0DMQ9 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
C8orf89P0DMQ9 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
C8orf89P0DMQ9 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
C8orf89P0DMQ9 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
C8orf89P0DMQ9 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
C8orf89P0DMQ9 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
C8orf89P0DMQ9 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
C8orf89P0DMQ9 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
C8orf89P0DMQ9 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
C8orf89P0DMQ9 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
C8orf89P0DMQ9 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
C8orf89P0DMQ9 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
C8orf89P0DMQ9 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
C8orf89P0DMQ9 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
C8orf89P0DMQ9 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
C8orf89P0DMQ9 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
C8orf89P0DMQ9 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
C8orf89P0DMQ9 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
C8orf89P0DMQ9 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
C8orf89P0DMQ9 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
C8orf89P0DMQ9 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
C8orf89P0DMQ9 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
C8orf89P0DMQ9 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
C8orf89P0DMQ9 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
C8orf89P0DMQ9 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
C8orf89P0DMQ9 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
C8orf89P0DMQ9 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
C8orf89P0DMQ9 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
C8orf89P0DMQ9 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
C8orf89P0DMQ9 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
C8orf89P0DMQ9 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
C8orf89P0DMQ9 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
C8orf89P0DMQ9 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
C8orf89P0DMQ9 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
C8orf89P0DMQ9 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
C8orf89P0DMQ9 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
C8orf89P0DMQ9 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
C8orf89P0DMQ9 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
C8orf89P0DMQ9 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
C8orf89P0DMQ9 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
C8orf89P0DMQ9 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
C8orf89P0DMQ9 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
C8orf89P0DMQ9 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
C8orf89P0DMQ9 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
C8orf89P0DMQ9 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
C8orf89P0DMQ9 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
C8orf89P0DMQ9 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
C8orf89P0DMQ9 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
C8orf89P0DMQ9 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
C8orf89P0DMQ9 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
C8orf89P0DMQ9 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
C8orf89P0DMQ9 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
C8orf89P0DMQ9 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
C8orf89P0DMQ9 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
C8orf89P0DMQ9 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
C8orf89P0DMQ9 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
C8orf89P0DMQ9 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
C8orf89P0DMQ9 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
C8orf89P0DMQ9 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
C8orf89P0DMQ9 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
C8orf89P0DMQ9 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
C8orf89P0DMQ9 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
C8orf89P0DMQ9 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
C8orf89P0DMQ9 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
C8orf89P0DMQ9 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
C8orf89P0DMQ9 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
C8orf89P0DMQ9 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
C8orf89P0DMQ9 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
C8orf89P0DMQ9 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
C8orf89P0DMQ9 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
C8orf89P0DMQ9 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
C8orf89P0DMQ9 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
C8orf89P0DMQ9 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
C8orf89P0DMQ9 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
C8orf89P0DMQ9 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
C8orf89P0DMQ9 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
C8orf89P0DMQ9 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
C8orf89P0DMQ9 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
C8orf89P0DMQ9 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
C8orf89P0DMQ9 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
C8orf89P0DMQ9 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
C8orf89P0DMQ9 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
C8orf89P0DMQ9 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
C8orf89P0DMQ9 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
C8orf89P0DMQ9 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms