Protein–RNA interactions for Protein: P02585

TNNC2, Troponin C, skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNC2P02585 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNNC2P02585 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNNC2P02585 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNNC2P02585 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNNC2P02585 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNNC2P02585 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNNC2P02585 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNNC2P02585 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNNC2P02585 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNNC2P02585 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNNC2P02585 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNNC2P02585 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNNC2P02585 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNNC2P02585 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNNC2P02585 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TNNC2P02585 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TNNC2P02585 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TNNC2P02585 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TNNC2P02585 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TNNC2P02585 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TNNC2P02585 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TNNC2P02585 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TNNC2P02585 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TNNC2P02585 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TNNC2P02585 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TNNC2P02585 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TNNC2P02585 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TNNC2P02585 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TNNC2P02585 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TNNC2P02585 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TNNC2P02585 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNNC2P02585 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNNC2P02585 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TNNC2P02585 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNNC2P02585 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNNC2P02585 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNNC2P02585 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNNC2P02585 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNNC2P02585 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNNC2P02585 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TNNC2P02585 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TNNC2P02585 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNNC2P02585 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNNC2P02585 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNNC2P02585 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNNC2P02585 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNNC2P02585 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNNC2P02585 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNNC2P02585 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNNC2P02585 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNNC2P02585 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNNC2P02585 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNNC2P02585 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNNC2P02585 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNNC2P02585 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TNNC2P02585 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNNC2P02585 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNNC2P02585 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNNC2P02585 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNNC2P02585 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNNC2P02585 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNNC2P02585 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNNC2P02585 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNNC2P02585 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNNC2P02585 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNNC2P02585 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNNC2P02585 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNNC2P02585 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNNC2P02585 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNNC2P02585 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNNC2P02585 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNNC2P02585 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNNC2P02585 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNNC2P02585 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNNC2P02585 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNNC2P02585 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNNC2P02585 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNNC2P02585 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNNC2P02585 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNNC2P02585 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TNNC2P02585 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNNC2P02585 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNNC2P02585 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNNC2P02585 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TNNC2P02585 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TNNC2P02585 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TNNC2P02585 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TNNC2P02585 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TNNC2P02585 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TNNC2P02585 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TNNC2P02585 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNNC2P02585 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNNC2P02585 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNNC2P02585 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNNC2P02585 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNNC2P02585 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNNC2P02585 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNNC2P02585 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNNC2P02585 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNNC2P02585 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms