Protein–RNA interactions for Protein: P01768

IGHV3-30, Immunoglobulin heavy variable 3-30, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-30P01768 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHV3-30P01768 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHV3-30P01768 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHV3-30P01768 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHV3-30P01768 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHV3-30P01768 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHV3-30P01768 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHV3-30P01768 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHV3-30P01768 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHV3-30P01768 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHV3-30P01768 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHV3-30P01768 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHV3-30P01768 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHV3-30P01768 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHV3-30P01768 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHV3-30P01768 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHV3-30P01768 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHV3-30P01768 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHV3-30P01768 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHV3-30P01768 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHV3-30P01768 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHV3-30P01768 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGHV3-30P01768 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGHV3-30P01768 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGHV3-30P01768 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGHV3-30P01768 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGHV3-30P01768 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGHV3-30P01768 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGHV3-30P01768 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGHV3-30P01768 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGHV3-30P01768 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGHV3-30P01768 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGHV3-30P01768 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGHV3-30P01768 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGHV3-30P01768 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGHV3-30P01768 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGHV3-30P01768 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGHV3-30P01768 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IGHV3-30P01768 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
IGHV3-30P01768 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
IGHV3-30P01768 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHV3-30P01768 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHV3-30P01768 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHV3-30P01768 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHV3-30P01768 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHV3-30P01768 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHV3-30P01768 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHV3-30P01768 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHV3-30P01768 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHV3-30P01768 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHV3-30P01768 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHV3-30P01768 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHV3-30P01768 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHV3-30P01768 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHV3-30P01768 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHV3-30P01768 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHV3-30P01768 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHV3-30P01768 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHV3-30P01768 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHV3-30P01768 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHV3-30P01768 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHV3-30P01768 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHV3-30P01768 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHV3-30P01768 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHV3-30P01768 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHV3-30P01768 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHV3-30P01768 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHV3-30P01768 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHV3-30P01768 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHV3-30P01768 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHV3-30P01768 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHV3-30P01768 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHV3-30P01768 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHV3-30P01768 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHV3-30P01768 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHV3-30P01768 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHV3-30P01768 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHV3-30P01768 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHV3-30P01768 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHV3-30P01768 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHV3-30P01768 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHV3-30P01768 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHV3-30P01768 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHV3-30P01768 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHV3-30P01768 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHV3-30P01768 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHV3-30P01768 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHV3-30P01768 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHV3-30P01768 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHV3-30P01768 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHV3-30P01768 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHV3-30P01768 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHV3-30P01768 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHV3-30P01768 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHV3-30P01768 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHV3-30P01768 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHV3-30P01768 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHV3-30P01768 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHV3-30P01768 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHV3-30P01768 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms