Protein–RNA interactions for Protein: O95782

AP2A1, AP-2 complex subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP2A1O95782 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AP2A1O95782 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AP2A1O95782 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AP2A1O95782 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AP2A1O95782 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AP2A1O95782 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
AP2A1O95782 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
AP2A1O95782 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AP2A1O95782 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AP2A1O95782 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AP2A1O95782 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AP2A1O95782 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AP2A1O95782 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AP2A1O95782 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AP2A1O95782 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AP2A1O95782 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AP2A1O95782 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AP2A1O95782 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AP2A1O95782 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AP2A1O95782 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AP2A1O95782 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AP2A1O95782 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AP2A1O95782 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AP2A1O95782 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AP2A1O95782 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AP2A1O95782 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AP2A1O95782 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AP2A1O95782 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
AP2A1O95782 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AP2A1O95782 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AP2A1O95782 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AP2A1O95782 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AP2A1O95782 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AP2A1O95782 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AP2A1O95782 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AP2A1O95782 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AP2A1O95782 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AP2A1O95782 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AP2A1O95782 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AP2A1O95782 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AP2A1O95782 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AP2A1O95782 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
AP2A1O95782 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AP2A1O95782 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AP2A1O95782 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AP2A1O95782 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AP2A1O95782 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AP2A1O95782 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AP2A1O95782 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AP2A1O95782 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AP2A1O95782 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AP2A1O95782 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AP2A1O95782 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AP2A1O95782 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AP2A1O95782 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AP2A1O95782 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AP2A1O95782 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AP2A1O95782 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AP2A1O95782 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AP2A1O95782 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AP2A1O95782 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AP2A1O95782 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
AP2A1O95782 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AP2A1O95782 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AP2A1O95782 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AP2A1O95782 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AP2A1O95782 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AP2A1O95782 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AP2A1O95782 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AP2A1O95782 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AP2A1O95782 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AP2A1O95782 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AP2A1O95782 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AP2A1O95782 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AP2A1O95782 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AP2A1O95782 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
AP2A1O95782 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AP2A1O95782 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AP2A1O95782 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
AP2A1O95782 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
AP2A1O95782 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AP2A1O95782 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AP2A1O95782 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AP2A1O95782 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AP2A1O95782 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AP2A1O95782 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AP2A1O95782 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AP2A1O95782 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AP2A1O95782 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AP2A1O95782 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AP2A1O95782 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AP2A1O95782 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AP2A1O95782 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AP2A1O95782 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AP2A1O95782 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AP2A1O95782 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AP2A1O95782 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
AP2A1O95782 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
AP2A1O95782 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
AP2A1O95782 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms