Protein–RNA interactions for Protein: O95630

STAMBP, STAM-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAMBPO95630 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
STAMBPO95630 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
STAMBPO95630 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
STAMBPO95630 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
STAMBPO95630 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
STAMBPO95630 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
STAMBPO95630 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
STAMBPO95630 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
STAMBPO95630 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
STAMBPO95630 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
STAMBPO95630 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
STAMBPO95630 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
STAMBPO95630 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
STAMBPO95630 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
STAMBPO95630 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
STAMBPO95630 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
STAMBPO95630 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
STAMBPO95630 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
STAMBPO95630 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
STAMBPO95630 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
STAMBPO95630 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
STAMBPO95630 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
STAMBPO95630 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
STAMBPO95630 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
STAMBPO95630 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
STAMBPO95630 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
STAMBPO95630 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
STAMBPO95630 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
STAMBPO95630 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
STAMBPO95630 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
STAMBPO95630 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
STAMBPO95630 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
STAMBPO95630 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
STAMBPO95630 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
STAMBPO95630 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
STAMBPO95630 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
STAMBPO95630 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
STAMBPO95630 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
STAMBPO95630 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
STAMBPO95630 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
STAMBPO95630 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
STAMBPO95630 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
STAMBPO95630 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
STAMBPO95630 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
STAMBPO95630 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
STAMBPO95630 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
STAMBPO95630 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
STAMBPO95630 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
STAMBPO95630 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
STAMBPO95630 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
STAMBPO95630 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
STAMBPO95630 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
STAMBPO95630 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
STAMBPO95630 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
STAMBPO95630 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
STAMBPO95630 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
STAMBPO95630 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
STAMBPO95630 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
STAMBPO95630 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
STAMBPO95630 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
STAMBPO95630 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
STAMBPO95630 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
STAMBPO95630 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
STAMBPO95630 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
STAMBPO95630 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
STAMBPO95630 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
STAMBPO95630 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
STAMBPO95630 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
STAMBPO95630 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
STAMBPO95630 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
STAMBPO95630 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
STAMBPO95630 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
STAMBPO95630 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
STAMBPO95630 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
STAMBPO95630 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
STAMBPO95630 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
STAMBPO95630 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
STAMBPO95630 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
STAMBPO95630 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
STAMBPO95630 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
STAMBPO95630 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
STAMBPO95630 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
STAMBPO95630 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
STAMBPO95630 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
STAMBPO95630 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
STAMBPO95630 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
STAMBPO95630 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
STAMBPO95630 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
STAMBPO95630 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
STAMBPO95630 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
STAMBPO95630 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
STAMBPO95630 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
STAMBPO95630 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
STAMBPO95630 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
STAMBPO95630 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
STAMBPO95630 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
STAMBPO95630 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
STAMBPO95630 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
STAMBPO95630 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
STAMBPO95630 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms