Protein–RNA interactions for Protein: O95295

SNAPIN, SNARE-associated protein Snapin, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPINO95295 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
SNAPINO95295 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNAPINO95295 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNAPINO95295 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNAPINO95295 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNAPINO95295 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNAPINO95295 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNAPINO95295 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNAPINO95295 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNAPINO95295 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNAPINO95295 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNAPINO95295 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNAPINO95295 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNAPINO95295 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNAPINO95295 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNAPINO95295 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNAPINO95295 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNAPINO95295 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNAPINO95295 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNAPINO95295 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNAPINO95295 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SNAPINO95295 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNAPINO95295 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNAPINO95295 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNAPINO95295 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNAPINO95295 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNAPINO95295 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNAPINO95295 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNAPINO95295 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNAPINO95295 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNAPINO95295 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNAPINO95295 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNAPINO95295 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNAPINO95295 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNAPINO95295 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNAPINO95295 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNAPINO95295 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNAPINO95295 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNAPINO95295 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNAPINO95295 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNAPINO95295 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNAPINO95295 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNAPINO95295 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNAPINO95295 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNAPINO95295 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNAPINO95295 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNAPINO95295 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNAPINO95295 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNAPINO95295 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNAPINO95295 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNAPINO95295 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNAPINO95295 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNAPINO95295 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNAPINO95295 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNAPINO95295 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNAPINO95295 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNAPINO95295 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNAPINO95295 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNAPINO95295 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNAPINO95295 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNAPINO95295 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNAPINO95295 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNAPINO95295 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNAPINO95295 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNAPINO95295 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNAPINO95295 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNAPINO95295 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNAPINO95295 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNAPINO95295 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNAPINO95295 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNAPINO95295 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNAPINO95295 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNAPINO95295 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNAPINO95295 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNAPINO95295 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNAPINO95295 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNAPINO95295 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNAPINO95295 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNAPINO95295 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNAPINO95295 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNAPINO95295 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNAPINO95295 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNAPINO95295 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNAPINO95295 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNAPINO95295 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNAPINO95295 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNAPINO95295 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNAPINO95295 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNAPINO95295 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNAPINO95295 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNAPINO95295 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNAPINO95295 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNAPINO95295 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNAPINO95295 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNAPINO95295 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNAPINO95295 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNAPINO95295 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNAPINO95295 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNAPINO95295 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNAPINO95295 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms