Protein–RNA interactions for Protein: O94979

SEC31A, Protein transport protein Sec31A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC31AO94979 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEC31AO94979 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEC31AO94979 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEC31AO94979 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEC31AO94979 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEC31AO94979 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEC31AO94979 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEC31AO94979 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEC31AO94979 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SEC31AO94979 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SEC31AO94979 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEC31AO94979 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEC31AO94979 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEC31AO94979 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEC31AO94979 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEC31AO94979 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEC31AO94979 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEC31AO94979 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEC31AO94979 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SEC31AO94979 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEC31AO94979 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEC31AO94979 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SEC31AO94979 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEC31AO94979 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEC31AO94979 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEC31AO94979 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEC31AO94979 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEC31AO94979 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEC31AO94979 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEC31AO94979 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEC31AO94979 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEC31AO94979 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEC31AO94979 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEC31AO94979 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEC31AO94979 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEC31AO94979 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEC31AO94979 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEC31AO94979 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEC31AO94979 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEC31AO94979 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEC31AO94979 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEC31AO94979 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEC31AO94979 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEC31AO94979 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEC31AO94979 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEC31AO94979 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEC31AO94979 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEC31AO94979 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEC31AO94979 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEC31AO94979 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEC31AO94979 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEC31AO94979 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEC31AO94979 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEC31AO94979 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEC31AO94979 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEC31AO94979 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEC31AO94979 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEC31AO94979 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SEC31AO94979 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SEC31AO94979 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEC31AO94979 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEC31AO94979 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEC31AO94979 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEC31AO94979 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEC31AO94979 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEC31AO94979 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEC31AO94979 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEC31AO94979 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEC31AO94979 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEC31AO94979 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEC31AO94979 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEC31AO94979 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEC31AO94979 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEC31AO94979 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEC31AO94979 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEC31AO94979 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEC31AO94979 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEC31AO94979 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEC31AO94979 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEC31AO94979 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEC31AO94979 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEC31AO94979 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEC31AO94979 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEC31AO94979 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEC31AO94979 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEC31AO94979 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEC31AO94979 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEC31AO94979 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEC31AO94979 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEC31AO94979 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEC31AO94979 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEC31AO94979 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEC31AO94979 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEC31AO94979 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEC31AO94979 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEC31AO94979 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEC31AO94979 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEC31AO94979 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEC31AO94979 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEC31AO94979 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms