Protein–RNA interactions for Protein: O75578

ITGA10, Integrin alpha-10, humanhuman

Predictions only

Length 1,167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA10O75578 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ITGA10O75578 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ITGA10O75578 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ITGA10O75578 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ITGA10O75578 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ITGA10O75578 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ITGA10O75578 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ITGA10O75578 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
ITGA10O75578 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ITGA10O75578 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ITGA10O75578 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ITGA10O75578 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ITGA10O75578 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ITGA10O75578 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ITGA10O75578 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ITGA10O75578 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ITGA10O75578 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ITGA10O75578 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ITGA10O75578 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ITGA10O75578 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ITGA10O75578 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ITGA10O75578 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ITGA10O75578 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ITGA10O75578 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ITGA10O75578 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ITGA10O75578 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ITGA10O75578 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ITGA10O75578 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ITGA10O75578 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ITGA10O75578 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ITGA10O75578 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ITGA10O75578 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ITGA10O75578 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ITGA10O75578 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ITGA10O75578 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ITGA10O75578 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ITGA10O75578 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ITGA10O75578 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ITGA10O75578 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ITGA10O75578 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ITGA10O75578 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ITGA10O75578 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ITGA10O75578 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGA10O75578 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGA10O75578 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGA10O75578 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGA10O75578 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGA10O75578 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGA10O75578 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGA10O75578 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGA10O75578 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGA10O75578 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGA10O75578 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGA10O75578 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGA10O75578 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGA10O75578 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGA10O75578 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGA10O75578 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGA10O75578 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGA10O75578 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGA10O75578 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGA10O75578 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGA10O75578 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGA10O75578 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGA10O75578 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGA10O75578 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGA10O75578 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGA10O75578 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGA10O75578 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGA10O75578 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGA10O75578 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGA10O75578 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGA10O75578 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGA10O75578 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGA10O75578 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGA10O75578 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGA10O75578 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGA10O75578 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGA10O75578 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGA10O75578 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGA10O75578 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGA10O75578 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGA10O75578 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGA10O75578 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ITGA10O75578 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ITGA10O75578 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ITGA10O75578 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ITGA10O75578 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ITGA10O75578 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ITGA10O75578 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ITGA10O75578 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ITGA10O75578 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ITGA10O75578 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ITGA10O75578 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ITGA10O75578 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGA10O75578 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGA10O75578 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGA10O75578 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGA10O75578 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGA10O75578 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms