Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SKAP2O75563 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SKAP2O75563 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SKAP2O75563 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SKAP2O75563 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SKAP2O75563 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SKAP2O75563 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SKAP2O75563 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SKAP2O75563 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SKAP2O75563 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SKAP2O75563 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SKAP2O75563 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SKAP2O75563 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SKAP2O75563 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SKAP2O75563 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SKAP2O75563 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SKAP2O75563 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SKAP2O75563 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SKAP2O75563 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SKAP2O75563 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SKAP2O75563 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SKAP2O75563 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SKAP2O75563 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SKAP2O75563 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SKAP2O75563 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SKAP2O75563 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SKAP2O75563 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SKAP2O75563 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SKAP2O75563 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SKAP2O75563 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SKAP2O75563 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SKAP2O75563 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SKAP2O75563 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SKAP2O75563 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SKAP2O75563 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SKAP2O75563 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SKAP2O75563 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SKAP2O75563 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SKAP2O75563 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SKAP2O75563 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SKAP2O75563 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SKAP2O75563 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SKAP2O75563 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SKAP2O75563 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SKAP2O75563 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SKAP2O75563 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SKAP2O75563 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SKAP2O75563 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SKAP2O75563 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SKAP2O75563 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SKAP2O75563 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SKAP2O75563 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SKAP2O75563 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SKAP2O75563 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SKAP2O75563 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SKAP2O75563 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SKAP2O75563 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SKAP2O75563 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SKAP2O75563 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SKAP2O75563 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SKAP2O75563 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SKAP2O75563 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SKAP2O75563 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SKAP2O75563 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SKAP2O75563 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SKAP2O75563 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SKAP2O75563 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SKAP2O75563 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SKAP2O75563 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SKAP2O75563 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SKAP2O75563 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SKAP2O75563 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SKAP2O75563 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SKAP2O75563 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SKAP2O75563 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SKAP2O75563 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SKAP2O75563 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SKAP2O75563 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SKAP2O75563 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SKAP2O75563 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SKAP2O75563 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SKAP2O75563 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SKAP2O75563 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SKAP2O75563 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SKAP2O75563 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SKAP2O75563 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SKAP2O75563 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SKAP2O75563 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SKAP2O75563 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SKAP2O75563 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SKAP2O75563 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SKAP2O75563 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SKAP2O75563 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SKAP2O75563 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SKAP2O75563 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SKAP2O75563 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SKAP2O75563 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SKAP2O75563 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SKAP2O75563 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SKAP2O75563 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms