Protein–RNA interactions for Protein: O60443

DFNA5, Non-syndromic hearing impairment protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DFNA5O60443 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DFNA5O60443 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
DFNA5O60443 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
DFNA5O60443 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
DFNA5O60443 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
DFNA5O60443 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
DFNA5O60443 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DFNA5O60443 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DFNA5O60443 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DFNA5O60443 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DFNA5O60443 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
DFNA5O60443 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DFNA5O60443 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DFNA5O60443 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DFNA5O60443 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DFNA5O60443 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DFNA5O60443 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DFNA5O60443 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DFNA5O60443 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DFNA5O60443 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DFNA5O60443 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DFNA5O60443 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DFNA5O60443 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DFNA5O60443 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DFNA5O60443 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DFNA5O60443 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DFNA5O60443 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DFNA5O60443 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DFNA5O60443 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DFNA5O60443 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DFNA5O60443 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DFNA5O60443 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DFNA5O60443 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DFNA5O60443 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DFNA5O60443 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DFNA5O60443 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DFNA5O60443 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DFNA5O60443 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DFNA5O60443 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DFNA5O60443 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DFNA5O60443 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DFNA5O60443 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DFNA5O60443 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DFNA5O60443 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DFNA5O60443 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DFNA5O60443 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DFNA5O60443 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DFNA5O60443 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DFNA5O60443 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DFNA5O60443 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DFNA5O60443 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DFNA5O60443 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
DFNA5O60443 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DFNA5O60443 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DFNA5O60443 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DFNA5O60443 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DFNA5O60443 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DFNA5O60443 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DFNA5O60443 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DFNA5O60443 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DFNA5O60443 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DFNA5O60443 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DFNA5O60443 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DFNA5O60443 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DFNA5O60443 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DFNA5O60443 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DFNA5O60443 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DFNA5O60443 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DFNA5O60443 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DFNA5O60443 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DFNA5O60443 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DFNA5O60443 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DFNA5O60443 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DFNA5O60443 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DFNA5O60443 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DFNA5O60443 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DFNA5O60443 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DFNA5O60443 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
DFNA5O60443 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DFNA5O60443 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DFNA5O60443 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DFNA5O60443 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DFNA5O60443 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DFNA5O60443 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DFNA5O60443 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
DFNA5O60443 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DFNA5O60443 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DFNA5O60443 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DFNA5O60443 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DFNA5O60443 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DFNA5O60443 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DFNA5O60443 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DFNA5O60443 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DFNA5O60443 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DFNA5O60443 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DFNA5O60443 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DFNA5O60443 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DFNA5O60443 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
DFNA5O60443 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
DFNA5O60443 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms