Protein–RNA interactions for Protein: O43602

DCX, Neuronal migration protein doublecortin, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCXO43602 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DCXO43602 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DCXO43602 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DCXO43602 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DCXO43602 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DCXO43602 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DCXO43602 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DCXO43602 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DCXO43602 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DCXO43602 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
DCXO43602 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DCXO43602 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DCXO43602 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DCXO43602 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DCXO43602 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DCXO43602 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DCXO43602 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DCXO43602 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DCXO43602 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DCXO43602 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DCXO43602 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DCXO43602 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DCXO43602 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DCXO43602 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DCXO43602 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DCXO43602 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
DCXO43602 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
DCXO43602 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DCXO43602 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DCXO43602 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
DCXO43602 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
DCXO43602 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DCXO43602 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
DCXO43602 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DCXO43602 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DCXO43602 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DCXO43602 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DCXO43602 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DCXO43602 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DCXO43602 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
DCXO43602 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
DCXO43602 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DCXO43602 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DCXO43602 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DCXO43602 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DCXO43602 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DCXO43602 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DCXO43602 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DCXO43602 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DCXO43602 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DCXO43602 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DCXO43602 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DCXO43602 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DCXO43602 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DCXO43602 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DCXO43602 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DCXO43602 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DCXO43602 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DCXO43602 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DCXO43602 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DCXO43602 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DCXO43602 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DCXO43602 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
DCXO43602 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
DCXO43602 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
DCXO43602 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DCXO43602 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DCXO43602 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DCXO43602 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DCXO43602 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
DCXO43602 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DCXO43602 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DCXO43602 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DCXO43602 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
DCXO43602 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DCXO43602 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DCXO43602 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DCXO43602 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DCXO43602 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DCXO43602 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DCXO43602 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
DCXO43602 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DCXO43602 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DCXO43602 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DCXO43602 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DCXO43602 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DCXO43602 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DCXO43602 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DCXO43602 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DCXO43602 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
DCXO43602 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DCXO43602 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DCXO43602 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DCXO43602 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DCXO43602 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DCXO43602 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DCXO43602 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DCXO43602 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DCXO43602 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DCXO43602 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98 ms