Protein–RNA interactions for Protein: O43246

SLC7A4, Cationic amino acid transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC7A4O43246 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC7A4O43246 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC7A4O43246 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC7A4O43246 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC7A4O43246 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC7A4O43246 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC7A4O43246 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC7A4O43246 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC7A4O43246 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC7A4O43246 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC7A4O43246 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC7A4O43246 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC7A4O43246 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC7A4O43246 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC7A4O43246 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC7A4O43246 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC7A4O43246 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC7A4O43246 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC7A4O43246 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC7A4O43246 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC7A4O43246 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC7A4O43246 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC7A4O43246 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC7A4O43246 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC7A4O43246 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC7A4O43246 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC7A4O43246 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC7A4O43246 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC7A4O43246 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC7A4O43246 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC7A4O43246 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC7A4O43246 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC7A4O43246 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC7A4O43246 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC7A4O43246 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC7A4O43246 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC7A4O43246 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC7A4O43246 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC7A4O43246 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC7A4O43246 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC7A4O43246 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC7A4O43246 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC7A4O43246 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC7A4O43246 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC7A4O43246 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC7A4O43246 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC7A4O43246 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC7A4O43246 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC7A4O43246 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC7A4O43246 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC7A4O43246 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC7A4O43246 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC7A4O43246 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC7A4O43246 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC7A4O43246 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC7A4O43246 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC7A4O43246 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC7A4O43246 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC7A4O43246 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC7A4O43246 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC7A4O43246 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC7A4O43246 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC7A4O43246 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC7A4O43246 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC7A4O43246 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC7A4O43246 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC7A4O43246 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC7A4O43246 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC7A4O43246 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC7A4O43246 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC7A4O43246 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC7A4O43246 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC7A4O43246 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC7A4O43246 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC7A4O43246 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC7A4O43246 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC7A4O43246 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC7A4O43246 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC7A4O43246 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC7A4O43246 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC7A4O43246 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC7A4O43246 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC7A4O43246 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC7A4O43246 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC7A4O43246 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC7A4O43246 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC7A4O43246 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC7A4O43246 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC7A4O43246 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC7A4O43246 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC7A4O43246 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC7A4O43246 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC7A4O43246 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC7A4O43246 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC7A4O43246 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC7A4O43246 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC7A4O43246 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC7A4O43246 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC7A4O43246 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC7A4O43246 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms