Protein–RNA interactions for Protein: O15553

MEFV, Pyrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEFVO15553 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MEFVO15553 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MEFVO15553 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MEFVO15553 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MEFVO15553 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
MEFVO15553 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MEFVO15553 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MEFVO15553 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MEFVO15553 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MEFVO15553 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MEFVO15553 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MEFVO15553 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MEFVO15553 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MEFVO15553 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
MEFVO15553 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MEFVO15553 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MEFVO15553 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MEFVO15553 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MEFVO15553 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MEFVO15553 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MEFVO15553 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MEFVO15553 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MEFVO15553 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MEFVO15553 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MEFVO15553 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MEFVO15553 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MEFVO15553 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MEFVO15553 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MEFVO15553 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MEFVO15553 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MEFVO15553 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MEFVO15553 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MEFVO15553 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MEFVO15553 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MEFVO15553 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MEFVO15553 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MEFVO15553 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MEFVO15553 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MEFVO15553 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MEFVO15553 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
MEFVO15553 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MEFVO15553 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MEFVO15553 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MEFVO15553 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MEFVO15553 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MEFVO15553 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MEFVO15553 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MEFVO15553 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MEFVO15553 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MEFVO15553 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MEFVO15553 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MEFVO15553 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
MEFVO15553 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MEFVO15553 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MEFVO15553 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MEFVO15553 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MEFVO15553 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MEFVO15553 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MEFVO15553 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MEFVO15553 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MEFVO15553 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MEFVO15553 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MEFVO15553 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
MEFVO15553 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MEFVO15553 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MEFVO15553 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MEFVO15553 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MEFVO15553 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MEFVO15553 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MEFVO15553 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MEFVO15553 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.42
MEFVO15553 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MEFVO15553 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MEFVO15553 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
MEFVO15553 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
MEFVO15553 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
MEFVO15553 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MEFVO15553 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MEFVO15553 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MEFVO15553 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MEFVO15553 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MEFVO15553 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MEFVO15553 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
MEFVO15553 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MEFVO15553 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MEFVO15553 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MEFVO15553 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MEFVO15553 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MEFVO15553 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MEFVO15553 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MEFVO15553 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MEFVO15553 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MEFVO15553 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MEFVO15553 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MEFVO15553 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MEFVO15553 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MEFVO15553 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MEFVO15553 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MEFVO15553 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MEFVO15553 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms