Protein–RNA interactions for Protein: O15195

VILL, Villin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 856 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VILLO15195 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VILLO15195 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VILLO15195 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VILLO15195 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VILLO15195 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VILLO15195 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VILLO15195 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VILLO15195 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VILLO15195 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
VILLO15195 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VILLO15195 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VILLO15195 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VILLO15195 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VILLO15195 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VILLO15195 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VILLO15195 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VILLO15195 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VILLO15195 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
VILLO15195 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VILLO15195 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VILLO15195 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VILLO15195 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VILLO15195 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VILLO15195 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
VILLO15195 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VILLO15195 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VILLO15195 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VILLO15195 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VILLO15195 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
VILLO15195 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VILLO15195 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VILLO15195 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VILLO15195 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VILLO15195 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VILLO15195 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
VILLO15195 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VILLO15195 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VILLO15195 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VILLO15195 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VILLO15195 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VILLO15195 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VILLO15195 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VILLO15195 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VILLO15195 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VILLO15195 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VILLO15195 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VILLO15195 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VILLO15195 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
VILLO15195 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VILLO15195 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
VILLO15195 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VILLO15195 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
VILLO15195 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22■■□□□ 1.11
VILLO15195 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
VILLO15195 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
VILLO15195 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
VILLO15195 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
VILLO15195 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
VILLO15195 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VILLO15195 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VILLO15195 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VILLO15195 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VILLO15195 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VILLO15195 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VILLO15195 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VILLO15195 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VILLO15195 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
VILLO15195 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VILLO15195 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VILLO15195 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VILLO15195 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VILLO15195 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VILLO15195 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
VILLO15195 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VILLO15195 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VILLO15195 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VILLO15195 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VILLO15195 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VILLO15195 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VILLO15195 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VILLO15195 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VILLO15195 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VILLO15195 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
VILLO15195 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VILLO15195 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VILLO15195 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VILLO15195 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VILLO15195 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VILLO15195 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VILLO15195 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VILLO15195 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VILLO15195 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
VILLO15195 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
VILLO15195 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VILLO15195 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VILLO15195 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VILLO15195 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VILLO15195 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VILLO15195 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VILLO15195 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms