Protein–RNA interactions for Protein: O14975

SLC27A2, Very long-chain acyl-CoA synthetase, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A2O14975 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC27A2O14975 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC27A2O14975 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC27A2O14975 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC27A2O14975 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC27A2O14975 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC27A2O14975 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC27A2O14975 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC27A2O14975 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC27A2O14975 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC27A2O14975 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC27A2O14975 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC27A2O14975 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC27A2O14975 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC27A2O14975 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC27A2O14975 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC27A2O14975 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC27A2O14975 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC27A2O14975 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC27A2O14975 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC27A2O14975 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC27A2O14975 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC27A2O14975 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC27A2O14975 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC27A2O14975 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC27A2O14975 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC27A2O14975 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC27A2O14975 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC27A2O14975 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC27A2O14975 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC27A2O14975 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC27A2O14975 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC27A2O14975 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC27A2O14975 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC27A2O14975 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC27A2O14975 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC27A2O14975 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC27A2O14975 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC27A2O14975 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC27A2O14975 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC27A2O14975 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC27A2O14975 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC27A2O14975 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC27A2O14975 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC27A2O14975 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC27A2O14975 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC27A2O14975 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC27A2O14975 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC27A2O14975 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC27A2O14975 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC27A2O14975 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC27A2O14975 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC27A2O14975 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC27A2O14975 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC27A2O14975 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC27A2O14975 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC27A2O14975 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC27A2O14975 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC27A2O14975 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC27A2O14975 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC27A2O14975 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC27A2O14975 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC27A2O14975 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC27A2O14975 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC27A2O14975 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC27A2O14975 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC27A2O14975 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC27A2O14975 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC27A2O14975 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC27A2O14975 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC27A2O14975 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC27A2O14975 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC27A2O14975 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC27A2O14975 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC27A2O14975 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC27A2O14975 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC27A2O14975 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC27A2O14975 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC27A2O14975 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC27A2O14975 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC27A2O14975 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC27A2O14975 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC27A2O14975 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC27A2O14975 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC27A2O14975 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC27A2O14975 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC27A2O14975 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC27A2O14975 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC27A2O14975 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC27A2O14975 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC27A2O14975 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC27A2O14975 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC27A2O14975 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC27A2O14975 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC27A2O14975 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC27A2O14975 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC27A2O14975 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC27A2O14975 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC27A2O14975 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC27A2O14975 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms