Protein–RNA interactions for Protein: O14545

TRAFD1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAFD1O14545 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAFD1O14545 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAFD1O14545 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAFD1O14545 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAFD1O14545 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAFD1O14545 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAFD1O14545 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAFD1O14545 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAFD1O14545 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAFD1O14545 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAFD1O14545 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAFD1O14545 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAFD1O14545 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAFD1O14545 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAFD1O14545 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAFD1O14545 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAFD1O14545 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAFD1O14545 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAFD1O14545 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAFD1O14545 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAFD1O14545 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAFD1O14545 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAFD1O14545 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAFD1O14545 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAFD1O14545 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAFD1O14545 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAFD1O14545 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAFD1O14545 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAFD1O14545 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAFD1O14545 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAFD1O14545 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAFD1O14545 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAFD1O14545 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAFD1O14545 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAFD1O14545 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAFD1O14545 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAFD1O14545 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAFD1O14545 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAFD1O14545 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAFD1O14545 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAFD1O14545 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAFD1O14545 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAFD1O14545 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAFD1O14545 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAFD1O14545 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAFD1O14545 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAFD1O14545 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAFD1O14545 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAFD1O14545 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAFD1O14545 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAFD1O14545 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAFD1O14545 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAFD1O14545 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAFD1O14545 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAFD1O14545 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAFD1O14545 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAFD1O14545 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAFD1O14545 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAFD1O14545 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAFD1O14545 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAFD1O14545 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAFD1O14545 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAFD1O14545 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAFD1O14545 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAFD1O14545 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAFD1O14545 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAFD1O14545 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAFD1O14545 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAFD1O14545 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAFD1O14545 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAFD1O14545 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAFD1O14545 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAFD1O14545 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAFD1O14545 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRAFD1O14545 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAFD1O14545 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAFD1O14545 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAFD1O14545 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAFD1O14545 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAFD1O14545 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAFD1O14545 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAFD1O14545 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAFD1O14545 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAFD1O14545 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAFD1O14545 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAFD1O14545 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAFD1O14545 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAFD1O14545 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAFD1O14545 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAFD1O14545 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAFD1O14545 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAFD1O14545 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAFD1O14545 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAFD1O14545 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAFD1O14545 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAFD1O14545 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAFD1O14545 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAFD1O14545 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAFD1O14545 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAFD1O14545 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms