Protein–RNA interactions for Protein: O14525

ASTN1, Astrotactin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASTN1O14525 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ASTN1O14525 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ASTN1O14525 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ASTN1O14525 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ASTN1O14525 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ASTN1O14525 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ASTN1O14525 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ASTN1O14525 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ASTN1O14525 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ASTN1O14525 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
ASTN1O14525 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ASTN1O14525 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ASTN1O14525 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ASTN1O14525 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ASTN1O14525 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ASTN1O14525 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ASTN1O14525 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ASTN1O14525 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ASTN1O14525 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ASTN1O14525 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ASTN1O14525 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ASTN1O14525 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ASTN1O14525 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ASTN1O14525 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ASTN1O14525 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ASTN1O14525 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ASTN1O14525 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ASTN1O14525 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ASTN1O14525 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ASTN1O14525 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ASTN1O14525 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ASTN1O14525 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ASTN1O14525 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ASTN1O14525 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ASTN1O14525 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ASTN1O14525 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ASTN1O14525 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ASTN1O14525 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ASTN1O14525 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ASTN1O14525 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ASTN1O14525 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ASTN1O14525 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ASTN1O14525 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ASTN1O14525 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ASTN1O14525 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ASTN1O14525 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ASTN1O14525 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ASTN1O14525 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ASTN1O14525 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ASTN1O14525 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ASTN1O14525 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ASTN1O14525 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ASTN1O14525 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ASTN1O14525 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ASTN1O14525 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ASTN1O14525 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ASTN1O14525 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ASTN1O14525 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ASTN1O14525 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ASTN1O14525 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ASTN1O14525 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ASTN1O14525 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ASTN1O14525 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ASTN1O14525 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ASTN1O14525 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ASTN1O14525 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ASTN1O14525 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ASTN1O14525 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ASTN1O14525 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ASTN1O14525 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ASTN1O14525 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
ASTN1O14525 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ASTN1O14525 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ASTN1O14525 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ASTN1O14525 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ASTN1O14525 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ASTN1O14525 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ASTN1O14525 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ASTN1O14525 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ASTN1O14525 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ASTN1O14525 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ASTN1O14525 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ASTN1O14525 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ASTN1O14525 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ASTN1O14525 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ASTN1O14525 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ASTN1O14525 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ASTN1O14525 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ASTN1O14525 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ASTN1O14525 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ASTN1O14525 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
ASTN1O14525 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ASTN1O14525 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ASTN1O14525 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ASTN1O14525 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ASTN1O14525 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ASTN1O14525 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ASTN1O14525 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ASTN1O14525 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ASTN1O14525 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86 ms