Protein–RNA interactions for Protein: J3QQQ9

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QQQ9 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
J3QQQ9 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
J3QQQ9 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
J3QQQ9 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
J3QQQ9 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
J3QQQ9 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
J3QQQ9 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
J3QQQ9 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
J3QQQ9 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
J3QQQ9 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
J3QQQ9 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
J3QQQ9 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
J3QQQ9 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
J3QQQ9 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
J3QQQ9 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
J3QQQ9 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
J3QQQ9 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
J3QQQ9 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
J3QQQ9 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
J3QQQ9 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
J3QQQ9 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
J3QQQ9 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
J3QQQ9 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
J3QQQ9 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
J3QQQ9 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
J3QQQ9 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
J3QQQ9 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
J3QQQ9 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
J3QQQ9 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC15.06■□□□□ 0
J3QQQ9 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC15.06■□□□□ 0
J3QQQ9 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
J3QQQ9 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
J3QQQ9 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
J3QQQ9 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
J3QQQ9 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
J3QQQ9 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC15.06■□□□□ 0
J3QQQ9 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
J3QQQ9 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
J3QQQ9 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
J3QQQ9 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
J3QQQ9 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
J3QQQ9 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
J3QQQ9 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
J3QQQ9 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
J3QQQ9 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
J3QQQ9 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
J3QQQ9 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
J3QQQ9 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC15.05■□□□□ -0
J3QQQ9 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
J3QQQ9 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
J3QQQ9 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
J3QQQ9 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
J3QQQ9 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
J3QQQ9 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
J3QQQ9 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
J3QQQ9 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
J3QQQ9 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
J3QQQ9 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
J3QQQ9 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
J3QQQ9 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
J3QQQ9 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
J3QQQ9 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
J3QQQ9 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
J3QQQ9 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
J3QQQ9 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
J3QQQ9 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
J3QQQ9 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC15.04■□□□□ -0
J3QQQ9 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
J3QQQ9 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
J3QQQ9 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
J3QQQ9 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
J3QQQ9 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
J3QQQ9 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
J3QQQ9 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
J3QQQ9 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
J3QQQ9 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
J3QQQ9 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
J3QQQ9 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
J3QQQ9 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
J3QQQ9 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
J3QQQ9 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
J3QQQ9 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
J3QQQ9 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
J3QQQ9 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
J3QQQ9 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
J3QQQ9 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
J3QQQ9 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
J3QQQ9 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
J3QQQ9 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
J3QQQ9 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
J3QQQ9 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
J3QQQ9 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
J3QQQ9 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
J3QQQ9 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
J3QQQ9 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
J3QQQ9 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
J3QQQ9 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
J3QQQ9 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
J3QQQ9 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
J3QQQ9 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms