Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ERVV-1B6SEH8 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
ERVV-1B6SEH8 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
ERVV-1B6SEH8 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ERVV-1B6SEH8 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ERVV-1B6SEH8 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ERVV-1B6SEH8 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ERVV-1B6SEH8 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ERVV-1B6SEH8 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
ERVV-1B6SEH8 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
ERVV-1B6SEH8 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
ERVV-1B6SEH8 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ERVV-1B6SEH8 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ERVV-1B6SEH8 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ERVV-1B6SEH8 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
ERVV-1B6SEH8 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ERVV-1B6SEH8 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ERVV-1B6SEH8 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
ERVV-1B6SEH8 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ERVV-1B6SEH8 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ERVV-1B6SEH8 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ERVV-1B6SEH8 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ERVV-1B6SEH8 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ERVV-1B6SEH8 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ERVV-1B6SEH8 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ERVV-1B6SEH8 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ERVV-1B6SEH8 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ERVV-1B6SEH8 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ERVV-1B6SEH8 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ERVV-1B6SEH8 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ERVV-1B6SEH8 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ERVV-1B6SEH8 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ERVV-1B6SEH8 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ERVV-1B6SEH8 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ERVV-1B6SEH8 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ERVV-1B6SEH8 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ERVV-1B6SEH8 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ERVV-1B6SEH8 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ERVV-1B6SEH8 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ERVV-1B6SEH8 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ERVV-1B6SEH8 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ERVV-1B6SEH8 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ERVV-1B6SEH8 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ERVV-1B6SEH8 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ERVV-1B6SEH8 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ERVV-1B6SEH8 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ERVV-1B6SEH8 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ERVV-1B6SEH8 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
ERVV-1B6SEH8 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ERVV-1B6SEH8 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ERVV-1B6SEH8 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ERVV-1B6SEH8 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
ERVV-1B6SEH8 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ERVV-1B6SEH8 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ERVV-1B6SEH8 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ERVV-1B6SEH8 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ERVV-1B6SEH8 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ERVV-1B6SEH8 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ERVV-1B6SEH8 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ERVV-1B6SEH8 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ERVV-1B6SEH8 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ERVV-1B6SEH8 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ERVV-1B6SEH8 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ERVV-1B6SEH8 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ERVV-1B6SEH8 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ERVV-1B6SEH8 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ERVV-1B6SEH8 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ERVV-1B6SEH8 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
ERVV-1B6SEH8 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
ERVV-1B6SEH8 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ERVV-1B6SEH8 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ERVV-1B6SEH8 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ERVV-1B6SEH8 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ERVV-1B6SEH8 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ERVV-1B6SEH8 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
ERVV-1B6SEH8 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ERVV-1B6SEH8 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ERVV-1B6SEH8 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ERVV-1B6SEH8 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ERVV-1B6SEH8 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
ERVV-1B6SEH8 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ERVV-1B6SEH8 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ERVV-1B6SEH8 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ERVV-1B6SEH8 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ERVV-1B6SEH8 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ERVV-1B6SEH8 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ERVV-1B6SEH8 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ERVV-1B6SEH8 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ERVV-1B6SEH8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ERVV-1B6SEH8 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ERVV-1B6SEH8 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ERVV-1B6SEH8 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ERVV-1B6SEH8 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ERVV-1B6SEH8 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ERVV-1B6SEH8 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ERVV-1B6SEH8 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ERVV-1B6SEH8 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ERVV-1B6SEH8 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ERVV-1B6SEH8 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ERVV-1B6SEH8 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms