Protein–RNA interactions for Protein: B2RBV5

Putative MORF4 family-associated protein 1-like protein UPP, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B2RBV5 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
B2RBV5 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
B2RBV5 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
B2RBV5 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
B2RBV5 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
B2RBV5 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
B2RBV5 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
B2RBV5 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
B2RBV5 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
B2RBV5 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
B2RBV5 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
B2RBV5 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
B2RBV5 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
B2RBV5 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
B2RBV5 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
B2RBV5 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
B2RBV5 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
B2RBV5 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
B2RBV5 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
B2RBV5 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
B2RBV5 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
B2RBV5 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
B2RBV5 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
B2RBV5 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
B2RBV5 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
B2RBV5 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
B2RBV5 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
B2RBV5 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
B2RBV5 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
B2RBV5 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
B2RBV5 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
B2RBV5 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
B2RBV5 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
B2RBV5 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
B2RBV5 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
B2RBV5 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
B2RBV5 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
B2RBV5 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
B2RBV5 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
B2RBV5 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
B2RBV5 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
B2RBV5 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
B2RBV5 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
B2RBV5 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
B2RBV5 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
B2RBV5 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
B2RBV5 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
B2RBV5 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
B2RBV5 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
B2RBV5 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
B2RBV5 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
B2RBV5 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
B2RBV5 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
B2RBV5 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
B2RBV5 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
B2RBV5 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
B2RBV5 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
B2RBV5 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
B2RBV5 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
B2RBV5 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
B2RBV5 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
B2RBV5 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
B2RBV5 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
B2RBV5 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
B2RBV5 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
B2RBV5 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
B2RBV5 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
B2RBV5 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
B2RBV5 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
B2RBV5 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
B2RBV5 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
B2RBV5 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
B2RBV5 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
B2RBV5 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
B2RBV5 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
B2RBV5 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
B2RBV5 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
B2RBV5 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
B2RBV5 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
B2RBV5 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
B2RBV5 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
B2RBV5 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
B2RBV5 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
B2RBV5 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
B2RBV5 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
B2RBV5 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
B2RBV5 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
B2RBV5 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
B2RBV5 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
B2RBV5 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
B2RBV5 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
B2RBV5 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
B2RBV5 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
B2RBV5 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
B2RBV5 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
B2RBV5 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
B2RBV5 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
B2RBV5 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
B2RBV5 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
B2RBV5 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms