Protein–RNA interactions for Protein: A8MV81

HIGD1C, HIG1 domain family member 1C, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD1CA8MV81 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HIGD1CA8MV81 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HIGD1CA8MV81 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HIGD1CA8MV81 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HIGD1CA8MV81 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HIGD1CA8MV81 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HIGD1CA8MV81 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HIGD1CA8MV81 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HIGD1CA8MV81 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HIGD1CA8MV81 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HIGD1CA8MV81 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HIGD1CA8MV81 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HIGD1CA8MV81 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HIGD1CA8MV81 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
HIGD1CA8MV81 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HIGD1CA8MV81 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC16.39■□□□□ 0.22
HIGD1CA8MV81 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HIGD1CA8MV81 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HIGD1CA8MV81 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HIGD1CA8MV81 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HIGD1CA8MV81 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HIGD1CA8MV81 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HIGD1CA8MV81 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HIGD1CA8MV81 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HIGD1CA8MV81 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HIGD1CA8MV81 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HIGD1CA8MV81 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HIGD1CA8MV81 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HIGD1CA8MV81 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HIGD1CA8MV81 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HIGD1CA8MV81 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIGD1CA8MV81 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIGD1CA8MV81 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIGD1CA8MV81 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIGD1CA8MV81 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIGD1CA8MV81 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIGD1CA8MV81 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIGD1CA8MV81 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIGD1CA8MV81 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIGD1CA8MV81 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIGD1CA8MV81 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIGD1CA8MV81 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIGD1CA8MV81 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIGD1CA8MV81 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIGD1CA8MV81 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIGD1CA8MV81 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIGD1CA8MV81 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIGD1CA8MV81 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HIGD1CA8MV81 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HIGD1CA8MV81 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HIGD1CA8MV81 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HIGD1CA8MV81 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HIGD1CA8MV81 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HIGD1CA8MV81 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HIGD1CA8MV81 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HIGD1CA8MV81 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HIGD1CA8MV81 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HIGD1CA8MV81 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HIGD1CA8MV81 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HIGD1CA8MV81 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HIGD1CA8MV81 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HIGD1CA8MV81 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HIGD1CA8MV81 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HIGD1CA8MV81 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HIGD1CA8MV81 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HIGD1CA8MV81 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HIGD1CA8MV81 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HIGD1CA8MV81 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HIGD1CA8MV81 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HIGD1CA8MV81 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HIGD1CA8MV81 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HIGD1CA8MV81 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HIGD1CA8MV81 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HIGD1CA8MV81 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HIGD1CA8MV81 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HIGD1CA8MV81 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HIGD1CA8MV81 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HIGD1CA8MV81 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HIGD1CA8MV81 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HIGD1CA8MV81 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HIGD1CA8MV81 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HIGD1CA8MV81 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HIGD1CA8MV81 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HIGD1CA8MV81 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HIGD1CA8MV81 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HIGD1CA8MV81 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HIGD1CA8MV81 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HIGD1CA8MV81 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HIGD1CA8MV81 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HIGD1CA8MV81 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HIGD1CA8MV81 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HIGD1CA8MV81 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HIGD1CA8MV81 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HIGD1CA8MV81 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HIGD1CA8MV81 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HIGD1CA8MV81 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HIGD1CA8MV81 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HIGD1CA8MV81 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HIGD1CA8MV81 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HIGD1CA8MV81 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms