Protein–RNA interactions for Protein: A6NFT4

CFAP73, Cilia- and flagella-associated protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP73A6NFT4 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CFAP73A6NFT4 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CFAP73A6NFT4 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CFAP73A6NFT4 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CFAP73A6NFT4 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CFAP73A6NFT4 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CFAP73A6NFT4 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CFAP73A6NFT4 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CFAP73A6NFT4 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CFAP73A6NFT4 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CFAP73A6NFT4 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CFAP73A6NFT4 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CFAP73A6NFT4 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CFAP73A6NFT4 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CFAP73A6NFT4 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CFAP73A6NFT4 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CFAP73A6NFT4 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CFAP73A6NFT4 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CFAP73A6NFT4 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CFAP73A6NFT4 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CFAP73A6NFT4 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CFAP73A6NFT4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CFAP73A6NFT4 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CFAP73A6NFT4 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CFAP73A6NFT4 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CFAP73A6NFT4 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CFAP73A6NFT4 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CFAP73A6NFT4 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CFAP73A6NFT4 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CFAP73A6NFT4 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CFAP73A6NFT4 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CFAP73A6NFT4 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CFAP73A6NFT4 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CFAP73A6NFT4 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CFAP73A6NFT4 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CFAP73A6NFT4 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CFAP73A6NFT4 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CFAP73A6NFT4 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CFAP73A6NFT4 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CFAP73A6NFT4 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CFAP73A6NFT4 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CFAP73A6NFT4 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CFAP73A6NFT4 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CFAP73A6NFT4 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CFAP73A6NFT4 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CFAP73A6NFT4 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CFAP73A6NFT4 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CFAP73A6NFT4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CFAP73A6NFT4 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CFAP73A6NFT4 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CFAP73A6NFT4 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CFAP73A6NFT4 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CFAP73A6NFT4 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CFAP73A6NFT4 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CFAP73A6NFT4 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CFAP73A6NFT4 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CFAP73A6NFT4 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CFAP73A6NFT4 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CFAP73A6NFT4 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CFAP73A6NFT4 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CFAP73A6NFT4 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CFAP73A6NFT4 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CFAP73A6NFT4 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CFAP73A6NFT4 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CFAP73A6NFT4 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CFAP73A6NFT4 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CFAP73A6NFT4 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CFAP73A6NFT4 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CFAP73A6NFT4 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CFAP73A6NFT4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CFAP73A6NFT4 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CFAP73A6NFT4 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CFAP73A6NFT4 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CFAP73A6NFT4 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CFAP73A6NFT4 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CFAP73A6NFT4 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CFAP73A6NFT4 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CFAP73A6NFT4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CFAP73A6NFT4 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CFAP73A6NFT4 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CFAP73A6NFT4 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CFAP73A6NFT4 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CFAP73A6NFT4 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CFAP73A6NFT4 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CFAP73A6NFT4 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CFAP73A6NFT4 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CFAP73A6NFT4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CFAP73A6NFT4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CFAP73A6NFT4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CFAP73A6NFT4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CFAP73A6NFT4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CFAP73A6NFT4 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CFAP73A6NFT4 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CFAP73A6NFT4 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CFAP73A6NFT4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CFAP73A6NFT4 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CFAP73A6NFT4 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CFAP73A6NFT4 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CFAP73A6NFT4 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CFAP73A6NFT4 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms