Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
KLHL33A6NCF5 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
KLHL33A6NCF5 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
KLHL33A6NCF5 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
KLHL33A6NCF5 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
KLHL33A6NCF5 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLHL33A6NCF5 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLHL33A6NCF5 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
KLHL33A6NCF5 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLHL33A6NCF5 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLHL33A6NCF5 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLHL33A6NCF5 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLHL33A6NCF5 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLHL33A6NCF5 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLHL33A6NCF5 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
KLHL33A6NCF5 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLHL33A6NCF5 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLHL33A6NCF5 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLHL33A6NCF5 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLHL33A6NCF5 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLHL33A6NCF5 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLHL33A6NCF5 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLHL33A6NCF5 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLHL33A6NCF5 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLHL33A6NCF5 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLHL33A6NCF5 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLHL33A6NCF5 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLHL33A6NCF5 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLHL33A6NCF5 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLHL33A6NCF5 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLHL33A6NCF5 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLHL33A6NCF5 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLHL33A6NCF5 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLHL33A6NCF5 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLHL33A6NCF5 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLHL33A6NCF5 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLHL33A6NCF5 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLHL33A6NCF5 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
KLHL33A6NCF5 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLHL33A6NCF5 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLHL33A6NCF5 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLHL33A6NCF5 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLHL33A6NCF5 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLHL33A6NCF5 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLHL33A6NCF5 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLHL33A6NCF5 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLHL33A6NCF5 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLHL33A6NCF5 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLHL33A6NCF5 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLHL33A6NCF5 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLHL33A6NCF5 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL33A6NCF5 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL33A6NCF5 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL33A6NCF5 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL33A6NCF5 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL33A6NCF5 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL33A6NCF5 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL33A6NCF5 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL33A6NCF5 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL33A6NCF5 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL33A6NCF5 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL33A6NCF5 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL33A6NCF5 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL33A6NCF5 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLHL33A6NCF5 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLHL33A6NCF5 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLHL33A6NCF5 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLHL33A6NCF5 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLHL33A6NCF5 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLHL33A6NCF5 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLHL33A6NCF5 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLHL33A6NCF5 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
KLHL33A6NCF5 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLHL33A6NCF5 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLHL33A6NCF5 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLHL33A6NCF5 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLHL33A6NCF5 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLHL33A6NCF5 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLHL33A6NCF5 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLHL33A6NCF5 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLHL33A6NCF5 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLHL33A6NCF5 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLHL33A6NCF5 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLHL33A6NCF5 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLHL33A6NCF5 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLHL33A6NCF5 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLHL33A6NCF5 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLHL33A6NCF5 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLHL33A6NCF5 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
KLHL33A6NCF5 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLHL33A6NCF5 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLHL33A6NCF5 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLHL33A6NCF5 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLHL33A6NCF5 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLHL33A6NCF5 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLHL33A6NCF5 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
KLHL33A6NCF5 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLHL33A6NCF5 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLHL33A6NCF5 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
KLHL33A6NCF5 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms