Protein–RNA interactions for Protein: A4FU28

CTAGE9, cTAGE family member 9, humanhuman

Predictions only

Length 777 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTAGE9A4FU28 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTAGE9A4FU28 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTAGE9A4FU28 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CTAGE9A4FU28 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CTAGE9A4FU28 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CTAGE9A4FU28 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CTAGE9A4FU28 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CTAGE9A4FU28 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CTAGE9A4FU28 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CTAGE9A4FU28 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CTAGE9A4FU28 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CTAGE9A4FU28 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CTAGE9A4FU28 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CTAGE9A4FU28 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CTAGE9A4FU28 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CTAGE9A4FU28 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CTAGE9A4FU28 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CTAGE9A4FU28 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTAGE9A4FU28 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTAGE9A4FU28 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTAGE9A4FU28 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTAGE9A4FU28 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTAGE9A4FU28 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTAGE9A4FU28 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTAGE9A4FU28 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTAGE9A4FU28 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTAGE9A4FU28 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTAGE9A4FU28 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTAGE9A4FU28 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTAGE9A4FU28 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTAGE9A4FU28 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTAGE9A4FU28 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTAGE9A4FU28 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTAGE9A4FU28 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTAGE9A4FU28 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTAGE9A4FU28 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTAGE9A4FU28 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTAGE9A4FU28 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CTAGE9A4FU28 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTAGE9A4FU28 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTAGE9A4FU28 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTAGE9A4FU28 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTAGE9A4FU28 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTAGE9A4FU28 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTAGE9A4FU28 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTAGE9A4FU28 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTAGE9A4FU28 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTAGE9A4FU28 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTAGE9A4FU28 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTAGE9A4FU28 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CTAGE9A4FU28 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTAGE9A4FU28 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTAGE9A4FU28 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTAGE9A4FU28 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTAGE9A4FU28 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTAGE9A4FU28 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTAGE9A4FU28 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTAGE9A4FU28 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTAGE9A4FU28 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTAGE9A4FU28 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTAGE9A4FU28 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTAGE9A4FU28 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTAGE9A4FU28 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTAGE9A4FU28 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTAGE9A4FU28 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTAGE9A4FU28 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTAGE9A4FU28 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CTAGE9A4FU28 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTAGE9A4FU28 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTAGE9A4FU28 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTAGE9A4FU28 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTAGE9A4FU28 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTAGE9A4FU28 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTAGE9A4FU28 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTAGE9A4FU28 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTAGE9A4FU28 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTAGE9A4FU28 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTAGE9A4FU28 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTAGE9A4FU28 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTAGE9A4FU28 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTAGE9A4FU28 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTAGE9A4FU28 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTAGE9A4FU28 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTAGE9A4FU28 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTAGE9A4FU28 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTAGE9A4FU28 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTAGE9A4FU28 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTAGE9A4FU28 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTAGE9A4FU28 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTAGE9A4FU28 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTAGE9A4FU28 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTAGE9A4FU28 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTAGE9A4FU28 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTAGE9A4FU28 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CTAGE9A4FU28 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTAGE9A4FU28 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTAGE9A4FU28 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTAGE9A4FU28 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTAGE9A4FU28 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTAGE9A4FU28 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms