Protein–RNA interactions for Protein: A4D0S4

LAMB4, Laminin subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB4A4D0S4 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LAMB4A4D0S4 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LAMB4A4D0S4 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LAMB4A4D0S4 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LAMB4A4D0S4 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LAMB4A4D0S4 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LAMB4A4D0S4 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LAMB4A4D0S4 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LAMB4A4D0S4 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LAMB4A4D0S4 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LAMB4A4D0S4 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LAMB4A4D0S4 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LAMB4A4D0S4 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LAMB4A4D0S4 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LAMB4A4D0S4 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LAMB4A4D0S4 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LAMB4A4D0S4 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LAMB4A4D0S4 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LAMB4A4D0S4 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
LAMB4A4D0S4 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
LAMB4A4D0S4 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.08
LAMB4A4D0S4 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC28.01■■■□□ 2.08
LAMB4A4D0S4 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
LAMB4A4D0S4 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LAMB4A4D0S4 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LAMB4A4D0S4 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LAMB4A4D0S4 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LAMB4A4D0S4 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC28■■■□□ 2.07
LAMB4A4D0S4 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
LAMB4A4D0S4 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
LAMB4A4D0S4 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LAMB4A4D0S4 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LAMB4A4D0S4 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LAMB4A4D0S4 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LAMB4A4D0S4 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LAMB4A4D0S4 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
LAMB4A4D0S4 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LAMB4A4D0S4 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LAMB4A4D0S4 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LAMB4A4D0S4 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LAMB4A4D0S4 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LAMB4A4D0S4 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LAMB4A4D0S4 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LAMB4A4D0S4 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LAMB4A4D0S4 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LAMB4A4D0S4 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LAMB4A4D0S4 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LAMB4A4D0S4 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LAMB4A4D0S4 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LAMB4A4D0S4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LAMB4A4D0S4 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LAMB4A4D0S4 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LAMB4A4D0S4 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LAMB4A4D0S4 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LAMB4A4D0S4 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LAMB4A4D0S4 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LAMB4A4D0S4 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
LAMB4A4D0S4 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LAMB4A4D0S4 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
LAMB4A4D0S4 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LAMB4A4D0S4 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LAMB4A4D0S4 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
LAMB4A4D0S4 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LAMB4A4D0S4 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LAMB4A4D0S4 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LAMB4A4D0S4 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LAMB4A4D0S4 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LAMB4A4D0S4 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LAMB4A4D0S4 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
LAMB4A4D0S4 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LAMB4A4D0S4 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
LAMB4A4D0S4 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LAMB4A4D0S4 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
LAMB4A4D0S4 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LAMB4A4D0S4 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LAMB4A4D0S4 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LAMB4A4D0S4 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
LAMB4A4D0S4 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
LAMB4A4D0S4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
LAMB4A4D0S4 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
LAMB4A4D0S4 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
LAMB4A4D0S4 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
LAMB4A4D0S4 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
LAMB4A4D0S4 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
LAMB4A4D0S4 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
LAMB4A4D0S4 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
LAMB4A4D0S4 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
LAMB4A4D0S4 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
LAMB4A4D0S4 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
LAMB4A4D0S4 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
LAMB4A4D0S4 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
LAMB4A4D0S4 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
LAMB4A4D0S4 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LAMB4A4D0S4 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LAMB4A4D0S4 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LAMB4A4D0S4 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LAMB4A4D0S4 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
LAMB4A4D0S4 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
LAMB4A4D0S4 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
LAMB4A4D0S4 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms