Protein–RNA interactions for Protein: A2A2Y4

FRMD3, FERM domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD3A2A2Y4 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FRMD3A2A2Y4 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FRMD3A2A2Y4 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FRMD3A2A2Y4 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FRMD3A2A2Y4 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FRMD3A2A2Y4 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FRMD3A2A2Y4 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FRMD3A2A2Y4 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FRMD3A2A2Y4 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FRMD3A2A2Y4 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FRMD3A2A2Y4 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FRMD3A2A2Y4 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FRMD3A2A2Y4 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FRMD3A2A2Y4 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FRMD3A2A2Y4 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FRMD3A2A2Y4 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FRMD3A2A2Y4 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FRMD3A2A2Y4 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FRMD3A2A2Y4 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FRMD3A2A2Y4 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FRMD3A2A2Y4 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FRMD3A2A2Y4 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FRMD3A2A2Y4 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FRMD3A2A2Y4 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
FRMD3A2A2Y4 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FRMD3A2A2Y4 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FRMD3A2A2Y4 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FRMD3A2A2Y4 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
FRMD3A2A2Y4 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FRMD3A2A2Y4 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FRMD3A2A2Y4 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
FRMD3A2A2Y4 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
FRMD3A2A2Y4 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FRMD3A2A2Y4 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FRMD3A2A2Y4 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FRMD3A2A2Y4 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
FRMD3A2A2Y4 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FRMD3A2A2Y4 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FRMD3A2A2Y4 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FRMD3A2A2Y4 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FRMD3A2A2Y4 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FRMD3A2A2Y4 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FRMD3A2A2Y4 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FRMD3A2A2Y4 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FRMD3A2A2Y4 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FRMD3A2A2Y4 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
FRMD3A2A2Y4 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
FRMD3A2A2Y4 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FRMD3A2A2Y4 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FRMD3A2A2Y4 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FRMD3A2A2Y4 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FRMD3A2A2Y4 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FRMD3A2A2Y4 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FRMD3A2A2Y4 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FRMD3A2A2Y4 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FRMD3A2A2Y4 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FRMD3A2A2Y4 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FRMD3A2A2Y4 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FRMD3A2A2Y4 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FRMD3A2A2Y4 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FRMD3A2A2Y4 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FRMD3A2A2Y4 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FRMD3A2A2Y4 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FRMD3A2A2Y4 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FRMD3A2A2Y4 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FRMD3A2A2Y4 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FRMD3A2A2Y4 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FRMD3A2A2Y4 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FRMD3A2A2Y4 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FRMD3A2A2Y4 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
FRMD3A2A2Y4 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FRMD3A2A2Y4 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FRMD3A2A2Y4 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FRMD3A2A2Y4 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FRMD3A2A2Y4 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FRMD3A2A2Y4 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FRMD3A2A2Y4 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FRMD3A2A2Y4 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FRMD3A2A2Y4 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FRMD3A2A2Y4 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FRMD3A2A2Y4 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FRMD3A2A2Y4 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FRMD3A2A2Y4 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FRMD3A2A2Y4 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
FRMD3A2A2Y4 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FRMD3A2A2Y4 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FRMD3A2A2Y4 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
FRMD3A2A2Y4 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
FRMD3A2A2Y4 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FRMD3A2A2Y4 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FRMD3A2A2Y4 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FRMD3A2A2Y4 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FRMD3A2A2Y4 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FRMD3A2A2Y4 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FRMD3A2A2Y4 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FRMD3A2A2Y4 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FRMD3A2A2Y4 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FRMD3A2A2Y4 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FRMD3A2A2Y4 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FRMD3A2A2Y4 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms